“Diseño y síntesis de ligantes tipo base de Schiff con piridina y un

“ Difracción de Rayos X ”
Everardo Jaime Adán
Seminario de Fuerzas Intermoleculares
C
1
2
Detector
Objeto
Luz visible
Imagen magnificada
3
Haces
difractados
Cristal
Patrón de
dispersion en el
Espacio Recíproco
Filamento
Electrones
Detector
CCD
Tubo de Rayos X
4
En fase, intensidad alta
Parcialmente en fase
Fuera de fase, intensidad cero
5
Orificio pequeño
Orificio grande
Espacio real
Espacio recíproco
6
Vectores y ángulos
en la celda unitaria
Espacio real
Espacio recíproco
7
8
2q, h, k, l, I (hkl )
Información obtenida
del experimento de
Rayos X
9
2q, h, k, l, I (hkl )
Ley de Bragg
nl = 2 dhkl senq
10
2q, h, k, l, I (hkl )
nl = 2 dhkl senq
æ 1 ö æ h ö2 æ k ö2 æ l ö2
ç
÷ = ç ÷ +ç ÷ +ç ÷
è dhkl ø è a ø è b ø è c ø
11
1
r ( xyz) = S S S F ( hkl ) coséë2p ( hx + ky+ lz) - a ( hkl )ùû
VC hkl
I (hkl ) » F(hkl)
2
a, fases
12
Métodos Directos, técnicas
analíticas
Patterson
P ( uvw) =
2
1
S S S F ( hkl ) cos2p ( hu+ kv+ lw)
VC hkl
Átomo pesado
13
14
15
• Usando una base de datos cristalográfica (CSD Cambridge) es
posible identificar fragmentos moleculares que son aptos para
realizar una interacción intermolecular: SINTONES
SUPRAMOLECULARES
• Analizando una serie de datos en la base es posible establecer
intervalos de distancias y ángulos para las diferentes
interacciones intermoleculares
G. R. Desiraju, J. J. Vittal, A. Ramanan, Crystal Engineering A Textbook,
World Scientific, 2011.
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Los enlaces OHH de naturaleza más fuerte tienen un
rango más cerrado de distancias y ángulos de enlace
OHH en dímeros
de ácidos carboxílicos
G. R. Desiraju, J. J. Vittal, A. Ramanan, Crystal Engineering A Textbook,
World Scientific, 2011.
X-HA
CHH en compuestos
carbonílicos α,β-insaturados
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Ángulos de enlace
para grupos OHO
*n/senθ
*1/senθ, correción del cono
En el estado cristalino la tendencia
en los ángulos de los enlaces de
hidrógeno es hacia la linealidad
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Distancias de enlace HA, agua
como donador
X-HA
Aceptores
n
HA
Aceptores
n
HA
XA
XA
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• Análisis de distribuciones de densidad de
carga
• RAYOS X, Cálculos teóricos de alto nivel
• PM3, AIM
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Rayos X
PM3
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• Información que brinda un análisis de Rayos X:
Estereoquímica
Distancia
Ángulos
Bibliografia:
J. P. Glusker, K. Trueblood, Crystal Structure Analysis A Primer, Oxford
University Press, 2010.
G. R. Desiraju, J. J. Vittal, A. Ramanan, Crystal Engineering A Textbook,
World Scientific, 2011.
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