Problemas: Cambios conformacionales Problema I Para un péptido
Anuncio
Problemas: Cambios conformacionales Problema I Para un péptido de 10 aa, compare la degeneración del sistema si la transición ovillo-a-hélice sigue el modelo de todo-o-nada, el modelo cooperativo, y el modelo de cremallera. Evalúe la función de partición para los 3 modelos (usando =2x10-4 y s=1) Problema II Calcule las degeneraciones y entropías resultado de arrojar 10 veces la moneda y obtener todas caras, y obtener mitad cara y mitad seca. Problema III Estime para la transición desde una hélice 310 a una α-hélice , asumiendo que ovillo- α-hélice es ≈10-4 y depende solamente de la diferencia de la entropía conformacional. Problema IV El término de nucleación en la fusión del RNA de doble cadena es ≈10-7 . ¿Qué longitud de esta doble hebra tendrá iguales probabilidades de comenzar a fundirse en los extremos o en el interior? Problema V Secuencias alternadas de n pares de bases d(C∙G) pueden formar Z-DNA bajo tensión de superenrrollamiento negativo en DNAs circulares de tamaño n + 4269. Los estados intermedios de esta transición fueron observados como topoisómeros con los siguientes valores de ∆Lk: N 12 24 48 ∆Lk -12.5 -15.5 -22.0 Calcule el parámetro de nucleación y propagación para esta transición.
