Situación actual de los Programas Genéticos de Trucha en Chile

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Situación actual de los Programas Genéticos de Trucha en Chile
Jean Paul Lhorente, Msc. , Ph.D (c) 1
Temas a desarrollar:
• Conceptos básicos e historia
• Estatus del Mejoramiento Genético de Truchas
• Base genética de la producción de truchas en Chile
• Cuales son los rasgos de importancia económica
• Necesidad de implementar stocks performance
• Elementos de I+D que se deben considerar
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Conceptos básicos e historia
- Nombre Científico: Oncorhychus mykiss
- Origen: O. Pacífico – Norte América (Alaska- Baja California)
- Gran adaptabilidad: desde fines 1800, ha sido introducida, en Oceanía; América del Sur, Japón,
Europa, África y Sur de Asia.
- Existen dos formas más conocidas:
 Variedad que no migran al mar , trucha
agua dulce (ríos) pez de menor tamaño y
menor condición, Pan-size.
• Variedad anádroma, que migra al mar, trucha
steel-head, pez de mayor tamaño, Talla 3.0 kg,
adaptados a crecimiento en mar, estuarios y
lagos.
Ejemplo: Donaldson, Kamloop
3
Conceptos básicos e historia
-En su condición natural, trucha desova en primavera.
- El primer hatchery se establece en 1879, en río McCloud – California (fines siglo XIX).Por
diversos procesos de selección artificial y natural, y cruzamientos se han generado líneas:
-con patrones de desove de otoño (Lewis, 1944; Siitonen & Gall, 1989).
-crecimiento y producción ovas (Donaldson & Olson, 1955; Donaldson, 1973).
-desove en doble ciclo (2 veces por año) (Kato, 1978).
-crecimiento (Kincaid et al., 1977)
-crecimiento , maduración, y atributos productivos (Gjerde, 1986).
- etc.
-En 1890 se inicia cultivo de trucha en Europa (Dinamarca). Origen muchas líneas europeas
proviene del río McCloud.
- Línea/raza genética: Se refiere a una población que ha sufrido un proceso de diferenciación
genética, por causas de aislamiento reproductivo, selección natural o artificial y que mantiene
cada generación, atributos (fenotipos) que le son propios.
- Alta Variación (entre líneas): Seleccionadas/domesticadas
Crecimiento, Edad maduración Sexual,
Tiempo de desove, Composición carne, rendimientos
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Temas a desarrollar:
• Conceptos básicos e historia
• Estatus del Mejoramiento Genético de Truchas
• Base genética de la producción de truchas en Chile
• Cuales son los rasgos de importancia económica
• Necesidad de implementar stocks performance
• Elementos de I+D que se deben considerar
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Estatus Mejoramiento genético en truchas
Un Programa Genético debe tener….
Núcleo: Peces identificados con trazabilidad completa, donde se realiza la selección y se obtiene la mejora genética.
NUCLEO
FASE
MULTIPLICACION
PRODUCCION
CONSUMIDOR
6
Fase Multiplicación: Peces no necesariamente identificados con trazabilidad completa, cuyo objetivo es traspasar las mejoras genéticas a producción.
Mating (1 Male / 2-3 Female)
(Families:40-Half-Sib,100Full-Sib)
Desafíos Patógenos
80%
60%
40%
20%
0%
Pit-tagging of fish
250-300 fish/Fam
46121
46126
46134
46181
46033
46086
46122
46223
46061
46138
46079
46049
46083
46185
46245
46087
46129
46078
46115
46130
46154
46180
46204
46231
46241
46216
46226
46035
46060
46248
46017
46008
46170
46197
46034
46107
46045
46147
46022
46188
46089
46090
Ciclo Reproductivo Núcleo
Mortalidad
100%
Familias
Pre Smolt: Grading in 2 groups
Monitoring Pre-Smolt weight
Selection by EBV-Index
Life cycle
Pre-selected
Reyected
Slaughtering:
Carcass Quality Traits: 20-25 fish/Fam
smolt
Monitoring Harvest Weight
120-200 fish/Fam
Pre-Selecting broodstock
Masal selection (40-50%)
Proceso de selección formal en el Núcleo
Measured traits
(Performance)
BDatos
Pedigree
ID
Sex
Location
Mortality
Measurements
Pedigree
BLUP
Evaluation
Breeding Value
by trait
Tindex = (1.8)Growth + (0.18)RendFilete + ( 0.001)Mature + (0.07)Color + (0.01)Fat
ID
sex
dam
sire
Index value
G76F03
F
P02A03
P01E10
0.518
G69C12
F
P02D01
P03A02
1.21
G75D02
F
P02A03
P01E10
-0.16
G81E07
F
P02C04
P02H10
-0.74
G73H01
F
P02A11
P02H06
1.26
G56F04
F
P01A07
P01E09
4.007
0.15
0
GF3
Broodstock
selection
8
0
0
Mature Fat-color TrimD%
Economic Values
for breeding goals
Estatus Mejoramiento genético en truchas
Proceso Multiplicación formal
Reproductores seleccionados
del Núcleo por ranking TIndex
Parents
Reproductores (Grupos Multiplicadores)
Próxima Generación Núcleo
Ovas destinadas a Familias,
formadas, optimizando
Max +GG a Min + F
Ovas destinadas a ser reproductores, con
la mejora obtenida en Núcleo y en n°
suficiente para requerimientos de la
empresa
Aplicación biotecnológicas
(Pobl. Monosexo, Triploidias, Fotoperíodos)
Producción ovas para producción
9
Estatus Mejoramiento genético en truchas
Componentes Claves de un programa
•
•
•
Objetivos de mejoramiento claros
Poblaciones con genealogía/origen y trazables (Pittags ‐ Microsatélites)
Diseño Genético‐Estadístico del programa –
–
•
•
•
•
•
•
•
Control Ambiente Sistema registros de datos
Base de Datos de Alta calidad que refleje ese diseño
Metodología Evaluación Genética (BLUP) Implementada (Predicción Valor Genético)
Manejos adecuados (Estandarización Ambiental y eliminación de incertidumbres)
Estructura Eficiente para abastecer a producción (Multiplicación)
Complementación adecuada de las biotecnologías disponibles.
Soporte técnico competente
Ovas mejoradas deben venir con un predicción de performance de acuerdo a evaluación genética, para los objetivos de mejora.
Estatus Mejoramiento genético en truchas
Número de Clases Año
1 year
EJEMPLO
11
2 year
3 year
Estatus Mejoramiento genético en truchas
Año de inicio Programas Genéticos en Países
desarrollados + Chile (incompleto)
Abalone
9
Camarones
8
Ostras
7
Sea bass
6
Sea Bream
5
4
Troutlodge
3
2
Aquagen
Aquasearch
AquaChile
CMCh
MHCh
Invertec Huililco
1
Carpas
Chinook
Trucha
Coho
1971
1972
1973
1974
1975
1976
1977
1978
1979
1980
1981
1982
1983
1984
1985
1986
1987
1988
1989
1990
1991
1992
1993
1994
1995
1996
1997
1998
1999
2000
2001
2002
2003
2004
2005
2006
2007
2008
2009
2010
0
12
Atlantic cod
Salar
Estatus Mejoramiento genético en truchas
Producción acuícola proveniente de ovas mejoradas bajo un programa
Genético formal (North America, Europe and Oceania)
% Prod.
based in
improved
stocks
97
27
22
Gjedrem, 2004; M. Rye, et al., 2010
Temas a desarrollar:
• Conceptos básicos e historia
• Estatus del Mejoramiento Genético de Truchas
• Base genética de la producción de truchas en Chile
• Que se debe requerir a un programa genético
• Cuales son los rasgos de importancia económica
• Necesidad de implementar stocks performance
• Elementos de I+D que se deben considerar
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Base genética de la producción de trucha en Chile
Siembras
15
Millones Smolt
Salar
Coho
Trucha
Total
2003
106,0
46,7
42,8
195,5
2004
123,0
39,4
55,3
217,7
2005
139,1
39,3
73,2
251,6
2006
149,1
42,7
75,8
267,6
2007
222,8
66,2
93,2
382,2
2008
124,7
42,9
71,6
239,2
2009
21,8
34,2
44,9
100,8
2010
73,6
45,7
84,0
203,3
% Salares
% Coho
% Truchas
54,21
23,89
21,91
62,90
20,15
28,30
71,15
20,10
37,44
76,26
21,84
38,77
113,96
33,86
47,67
63,77
21,94
36,63
11,15
17,47
22,95
37,62
23,36
42,99
Base genética de la producción de trucha en Chile
Evolución Producción de Ovas de Trucha Período (1998‐2009)
300
Millones de Ovas
250
200
36%
150
100
57%
50
0
1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009
Nacional
Importado
Total
Año
41 millones ovas
2005
%
16
Ago Sept
Oct
Nov Dic Ene Feb Mar Abr May Jun
0,04 0,11 0,23 0,30 0,19 0,11 0,02
Jul
Base genética de la producción de trucha en Chile
Distribución Importacion Ovas Trucha año 2007 (104 millones)
Distribucion Importacion Ovas Trucha año 2006 (73 millones importados)
1 %
0
1 %
31 %
26 %
41 %
Dinamarca
45%
27%
Noruega
USA
USA
28 %
Otros
Distribución Importacion Ovas Truchas año 2010 (62 millones)
0
0
10%
Dinamarca
Noruega
USA
90%
17
Dinamarca
Noruega
Finlandia
0
0
Finlandia
Otros
Finlandia
Otros
Base genética de la producción de trucha en Chile
Flujo Material Genético
Base genética de la producción de trucha en Chile
Flujo Material Genético (Por cepas)
NLA, Osland
Donalson, Kamloop
Cofradex, FGFRI, Arvokala
Base genética de la producción de trucha en Chile
Principales proveedores Ovas importadas y sus líneas Kamloop/ McCleary, Steel-head
Trachsel
Fresh, Late, Salt
Cofradex
Hansen, Jutland, Ollerupgard,
Sandguild, Trachsel
Aquagen/NLA
Osland
FGFRI/Arvokala
20
Base genética de la producción de trucha en Chile
Principales proveedores Ovas importadas y sus líneas Rasgos
AquaGen
AquaSearch
TroutLodge
Trachsel
Salmobreed
TTM
SW
FW
FW
FW
SW
SW/FW
Crecimiento
x
X
X
X
X
X
Maduración
X
X
Conversión
X
X
Ciclo
X
X
X
COMO OPERA UN PROGRAMA DE ¡¡¡ Es necesario evaluarlas !!
MEJORA GENETICA EN SALMONES
Contenido Grasa Filete
X
Calidad
X
Color Piel
X
X
Rendimiento Filete
X
X
Resistencia IPN
Deformidades
Sobrevivencia
X
% Eclosión
X
Tolerancia Salinidad
X
X
X
X
Base genética de la producción de trucha en Chile
Ejemplos de Programas Genéticos Nacionales de truchas
Objetivos de mejora
Color plateado
Peso Cosecha
Color filete
Fecha inicio: 2000
Fecha inicio: 2005
Color plateado
Peso Cosecha
Color filete
Sin información
Salmones Quetro
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Base genética de la producción de trucha en Chile
Programas Genéticos Nacionales de truchas
• Se estima que los programas indicados no aportan mas del 40 % de la producción de ovas
nacionales requeridas anualmente.
• No hay resultados de respuesta a la selección convincentes en crecimiento, solo en coloración
de la piel.
• La producción restante se realiza en base a importación de ovas stocks y de reproductores
nacionales de los cuales no se conoce su composición y calidad genética, y no tiene impacto de
mejora,
•Efecto de la consanguinidad en crecimiento: -0.2 to -6% /+10 % F
•Necesario evaluar calidad genética poblacional
• Hay una gran oportunidad para iniciar programas de cría de trucha en Chile, que sean
competitivos y den solución a los requerimientos productivos de la Industria.
Temas a desarrollar:
• Conceptos básicos e historia
• Estatus del Mejoramiento Genético de Truchas
• Base genética de la producción de truchas en Chile
• Cuales son los rasgos de importancia económica
• Necesidad de implementar stocks performance
• Elementos de I+D que se deben considerar
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Rasgos de importancia Económica
Rasgos de Importancia Económica en Truchas
Mejor crecimiento, reducción del tiempo a cosecha
Maduración a edad tardía
Rendimiento Cortes en Planta
Calidad (pigmentación, contenido de grasa)
Mayor Tolerancia a comer Vegetales
Resistencia a Enfermedades (SRS, Caligus, IPN)
Tolerancia a mayores temperaturas
Desadaptación/Tolerancia a la salinidad
Objetivos a mejorar
Selección de Características
Costo, Factibilidad, Eficiencia de Selección
80/20
25
Rasgos de importancia Económica
Ejemplo Crecimiento y Mortalidad en S.salar
Características
Efecto en costo
1% de mayor (sgr)
‐ 6 ¢/kg
1% menos mortalidad
‐ 2 ¢/kg
5% mejor retención de pigmento
‐ 1 ¢/kg
26
Volumen
Ciclo Productivo Truchas
10-14 meses en mar
M.A.G /G.G.G (%)
Retorno Anual
Prod. (Tons)
SGR
Mortalidad
20 mil
1.25/5.0
1.0/4.0
‐U$ 475,000
20 mil
2.50/10.0
1.0/4.0
‐U$ 850,000
Total
40 mil
1.25/5.0
1.0/4.0
‐U$ 950,000
40 mil
2.50/10.0
1.0/4.0
‐U$ 1,700,000
60 mil
1.25/5.0
1.0/4.0
‐U$ 1,425,000
60 mil
2.50/10.0
1.0/4.0
‐U$ 2,550,000
80 mil
1.25/5.0
1.0/4.0
‐U$ 1,900,000
80 mil
2.50/10.0
1.0/4.0
‐U$ 3,400,000
M.A G (%)
Volumen (Tons)
SGR
20 mil
‐ U$ 300,000
‐ U$ 100,000
‐ U$ 400,000
40 mil
‐ U$ 600,000
‐ U$ 200,000
‐ U$ 800,000
60 mil
‐ U$ 900,000
‐ U$ 300,000
‐ U$ 1,200,000
80 mil
‐ U$ 1,200,000
‐ U$ 400,000
‐ U$ 1,600,000
100 mil
‐ U$ 1,500,000
‐ U$ 500,000
‐ U$ 2,000,000
Mortalidad
Rasgos de importancia Económica
Maduración Tardía
Ciclo reproductivo
1 year
2 year
3 year
 % Plateados
Coloración externa
27
Color carne
Rasgos de importancia Económica
Desadaptación peces en Mar y resistencia a Patógenos
Mortalidad Anual Acumulada
Período 2008 – 2011
15- 25 % ciclo cerrados
Según datos del la Industria
• 25,7% Rezagos por desadaptación
• 22,0% Enfermedades
• 18,7% Sin causa aparente
Enfermedades relevantes: IPN, SRS, Caligus
¡¡ Objetivos de Mejoramiento aun no implementados!!
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Temas a desarrollar:
• Conceptos básicos e historia
• Estatus del Mejoramiento Genético de Truchas
• Base genética de la producción de truchas en Chile
• Cuales son los rasgos de importancia económica
• Necesidad de implementar stocks performance
• Elementos de I+D que se deben considerar
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Implementación StockPerformances
• Validar el potencial productivo de las cepas disponibles.
• Realizar un testeo de la calidad de nuestra cepa bajo mejora.
• Explorar el uso de cruzamientos
• Debe realizarse al menos en tres años consecutivos
Escenarios de evaluación disponibles:
- Con datos de producción
- Establecer un diseño y pruebas de comportamiento específicas
30
Implementación Stock‐Performances
Diseño para evaluación de cepas
1. Línea 1
2. Línea 2
3. Línea 3
Coordinar n° ovas ojo suficiente contemporáneas Marcaje líneas a los 10-30 g
(corte de aletas, Criomarcas)
Se establece un rango de talla a marcar
Definir Min 2 replicas (jaulas de producción)
Evaluar:
‐Sobrevivencia y crecimiento agua dulce ‐Sobrevivencia y crecimiento mar
‐Nivel de rezago
‐Datos de Planta (calidad y rendimientos)
Mar
Estuario
Jaula Mix
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Temas a desarrollar:
• Conceptos básicos e historia
• Estatus del Mejoramiento Genético de Truchas
• Base genética de la producción de truchas en Chile
• Cuales son los rasgos de importancia económica
• Necesidad de implementar stocks performance
• Elementos de I+D que se deben considerar
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Elementos de I+D que se deben considerar
• Estudio de Interacción GxE
o Mayoría de proveedores son extranjeros y manejan sus stocks en agua dulce oEs necesario manejar stocks/núcleos en ciclos cerrados (FW‐SW/SW) ?
Especie
Rasgo
% Var.Total (SC)
Referencia
Salmón Atlántico
Crecimiento
1.3 – 3.1 %
Gunnes & Gjedrem, 1978
Salmón Atlántico
Madurez
23‐54 %
Wild et al., 1994
Trucha arcoiris
Crecimiento
1.1‐5.5 %
Gunnes & Gjedrem, 1981
Salmónidos
Resistencia Patógenos
¿ ?
‐
Escenario tradicional
Breeding goals
ID
G76F03
G69C12
G75D02
G81E07
G73H01
G56F04
Núcleo
dam
sire
Index value
P02A03 P01E10
0.518
P02D01 P03A02
1.21
P02A03 P01E10
-0.16
P02C04 P02H10
-0.74
P02A11 P02H06
1.26
P01A07 P01E09
4.007
Núcleo = Producción
Parents
33
sex
F
F
F
F
F
F
Elementos de I+D que se deben considerar
Estudio de Interacción GxE
Escenario ciclo cerrado
Breeding goals
Parents
ID
G76F03
G69C12
G75D02
G81E07
G73H01
G56F04
sex
F
F
F
F
F
F
dam
sire
Index value
P02A03 P01E10
0.518
P02D01 P03A02
1.21
P02A03 P01E10
-0.16
P02C04 P02H10
-0.74
P02A11 P02H06
1.26
P01A07 P01E09
4.007
Núcleo
Núcleo ≠ Producción
¡¡ DESAFÍO FUTURO !!
• GxE mayor magnitud
• Rediseño Programa
• Focalizado en Breeding Goals
Elementos de I+D y desafíos que se deben considerar a corto plazo
• Implementar protocolos de desafío (IPN, SRS, Caligus) para Trucha arcoiris
• Implementar y desarrollar formas de medición (fenotipos) de la condición de
desadaptación, a implementar como criterio de selección.
• Concatenar y optimizar el uso de biotecnologías en programas genéticos de truchas
• Conocer en detalle la composición genética de los stock nacionales sin programa.
Elementos de I+D a considerar a largo plazo
• Secuenciación genoma trucha
• Desarrollo y construcción de un Chip de SNP
• Implementación de selección genómica en resistencia a patógenos
35
Estación Experimental Lenca
36
Estación Experimental Lenca
¡¡ MUCHAS GRACIAS POR SU ATENCION !!
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