Programa - Universitat de València

LICENCIATURA DE BIOLOGÍA
PROGRAMA DE BIOQUÍMICA . CURSO 2006-2007
PROGRAMA DE TEORÍA (Profesora: M.ÀNGELS ULL.GRUPO A)
Objetivos:
El objetivo principal es dar una visión general de los fundamentos de la bioquímica. Se pretende
proporcionar al estudiante unos conocimientos básicos sobre la estructura y el funcionamiento de las
biomacromoléculas, sobre las formas de energía que emplean los seres vivos, y sobre el metabolismo
central y su regulación desde una perspectiva integrada.
Tema 1. Introducción. Composición química de los seres vivos: biomoléculas. Características de la
materia viva. Principios cinéticos y termodinámicos aplicados a los seres vivos. La célula como unidad de la
organización biológica. El papel del agua en los procesos biológicos.
I. Estructura y función de las proteínas
Tema 2. Estructura de proteínas. El enlace peptídico y estructura primaria. Estructura secundaria:
hélice-, hoja ß, giros. Motivos estructurales. Estructura terciaria y estructura cuaternaria: dominios
conformacionales de proteínas. Proteínas fibrosas y proteínas globulares. Plegamiento y desnaturalización de
proteínas.
Tema 3. Dinámica de proteínas. Unión de ligandos. Cooperatividad y alosterismo. Estudio de la
mioglobina y de la hemoglobina.
II. Enzimología
Tema 4. Naturaleza química de los enzimas. Centro activo. Especificidad enzimática. Clasificación
y nomenclatura de enzimas. Participación de cofactores en la actividad enzimática.
Tema 5. Cinética enzimática. Estado de transición. Cinética de las reacciones enzimáticas con un
sustrato: Ecuación de Michaelis-Menten. Efectos del pH y de la temperatura. Inhibición.
Tema 6. Mecanismos moleculares de la regulación enzimática. Regulación de la concentración
de enzima. Alosterismo. Modificación covalente de enzimas. Amplificación de señales.
III. Estructura y función de los ácidos nucleicos
Tema 7. Estructura y organización de los ácidos nucleicos . Procesos en el metabolismo
informacional. Estructura primaria. Estructura secundaria. Modelo de Watson y Crick. Estructuras
superiores; DNA circular y superenrollado. Organización de los genomas y estructura de los genes.
Tema 8. Replicación. DNA polimerasas; enzimología de la elongación de la cadena de polinucleótidos.
Reparación del DNA.
Tema 9. Transcripción. Enzimología de la síntesis de RNA. Mecanismo de la transcripción. Regulación
de la transcripción. Procesamiento postranscripcional.
Tema 10. Traducción. El código genético. Características de las moléculas que participan en la
traducción. El ribosoma. El mecanismo de la traducción; iniciación, elongación y terminación.
Modificaciones postraduccionales. Regulación de la síntesis proteica.
IV. Bioenergética
Tema 11. Sistema ATP-ADP. Flujo de energía en los sistemas biológicos.Acoplamiento entre las
reacciones endergónicas y exergónicas. Bioquímica del ATP. Estrategias para la generación de ATP.
Tema 12. Biomembranas y transporte. Estructura y propiedades de las membranas biológicas.
Termodinámica y cinética del transporte a través de membrana. Clasificación de los sistemas de transporte.
Teoría quimiosmótica.ATP sintasa
Tema 13. Cadena respiratoria. Transportadores electrónicos de la cadena respiratoria: Estructura.
Organización, función y regulación de la cadena de transporte electrónico mitocondrial y de la fosforilación
oxidativa. Otras cadenas de transporte electrónico.
Tema 14. Cadena fotosintética. Pigmentos fotosintéticos. Fotosistemas. Organización de los
transportadores electrónicos. Fotofosforilación cíclica y no cíclica. Fotosíntesis bacteriana.
V. Metabolismo intermediario
Tema 15. Panorama del metabolismo y de su control. Organización del metabolismo. Etapas de la
degradación de hidratos de carbono, lípidos y proteínas.
Tema 16. El acetil-CoA. Procedencia y destino del acetil-CoA. Ciclo del ácido cítrico: etapas
enzimáticas y regulación. Carácter anfibólico y reacciones anapleróticas del ciclo del ácido cítrico.
Tema 17. Metabolismo de hidratos de carbono. Glicolisis y gluconeogénesis: etapas enzimáticas y
regulación. Sustratos glicolíticos y gluconeogénicos; ciclo del glioxilato. Destinos del piruvato:
fermentaciones y descarboxilación oxidativa del piruvato. Metabolismo del glucógeno y regulación. Otras
rutas de utilización de la glucosa; ruta de los fosfatos de pentosa. Fijación autotrófica del CO2.
Fotorrespiración.
Tema 18. Metabolismo de lípidos. Digestión, absorción y transporte de triacilgliceroles: lipoproteínas.
Movilización de los lípidos de reserva. Degradación y biosíntesis de los ácidos grasos: etapas enzimáticas y
regulación. Formación y utilización de cuerpos cetónicos.
Tema 19. Metabolismo de compuestos nitrogenados. Degradación oxidativa de los aminoácidos.
Excreción del nitrógeno. Biosíntesis de aminoácidos. Fijación del nitrógeno. Metabolismo de nucleótidos.
Tema 20. Integración del metabolismo. Bioquímica tisular. Interrelaciones metabólicas durante el
ciclo ayuno-alimentación. Adaptaciones metabólicas.
Bibliografía
El contenido de las lecciones del programa está recogido, basicamente, en el libro Fonaments de Bioquimica de
Peretó,J,Sendra,R, Pamblanco,M. y Bañó,C.Vol 5, Col·lecció Educació.Sèrie Materials.Servei de Publicacions de
la Universitat de València. 5ª edición 2005.
Como bibliografía adicional se recomienda la siguiente:
Alberts, B. y colaboradores. Biología Molecular de la Célula. Ediciones Omega, 1996 (traducción de la 3ª ed. inglesa
de 1994).4ª edición traducida al español, Ed.Omega. 2004
Boyer,R. Conceptos de Bioquímica. International Thomson Editores.México. 2000
Devlin, T.M. Bioquímica. Libro de texto con aplicaciones clínicas. Ed. Reverté, 2004.
Herrera, E. Bioquímica. Aspectos estructurales y vías metabólicas. 2 tomos. MacGraw Hill Interamericana. 1991.
Mathews, C.K., Van Holde, K.E. y Ahern K.G. Bioquímica.3ª edición en español Pearson Educación. 2002.
McKee, T y McKee, J.M. Bioquímica. La Base Molecular de la Vida. MacGraw Hill Interamericana de España,
2003.
Nelson, D.L. y Cox, M.M. Lehninger Principios de Bioquímica. Ed. Omega, 3ª ed., 2001.
Rawn, J.D. Bioquímica. Ed. Interamericana MacGraw Hill, 2 tomos, 1989.
Stryer, L. Bioquímica. Ed. Reverté. 5ª ed. 2003.
Voet, D. y Voet, J.G. Bioquímica. Ed. Omega 1992. (3ª ed inglés, 2004).
Horario de atención a alumnos
Mª Angels Ull:
Martes: 15-18 h.
Miércoles 10 a 12 y 13.30 a 14.30 h.
Lugar: Departamento de Bioquímica. Edificio A, 2º piso, despacho 1206
PROGRAMA DE CLASES PRÁCTICAS
Objetivos
El objetivo de las clases prácticas es complementar los conocimientos de bioquímica adquiridos en
las clases de teoría. Para ello se propondrán una serie de cuestiones y de experimentos ligados al orden
temático de las lecciones que se proponen en el programa teórico. El estudiante ha de familiarizarse con el
trabajo en el laboratorio y adquirir una serie de conocimientos de diversas técnicas usualmente utilizadas.
Las prácticas de bioquímica consistirán en 20 horas de prácticas de laboratorio y 10 horas de
ejercicios prácticos en el aula. Estas prácticas se llevarán a cabo a lo largo del curso de acuerdo con el
calendario que se adjunta. La asistencia a las sesiones de laboratorio será obligatoria, y condición
indispensable para aprobar la asignatura.
Sesiones de laboratorio
Las prácticas de laboratorio se realizan en grupos de 16-20 estudiantes, que trabajarán en parejas, en
5 sesiones de 4 horas cada una (de 15,30-19,30). El calendario correspondiente a las cinco sesiones será:
Sesión
1
2
3
4
5
Punto isoeléctrico de las proteínas
Estudio de la actividad enzimática peroxidasa
Obtención y cuantificación de DNA
Reacciones luminosas de la fotosíntesis
Metabolismo de hidratos de carbono
A1
9-XI
30-XI
11-I
22-III
26-IV
Grupo
A2
A3
A4
9-XI 10-XI 10-XI
30-XI 1-XII 1-XII
11-I
12-I
12-I
22-III 23-III 23-III
26-IV 27-IV 27-IV
A5
8-XI
29-XI
10-I
21-III
25-IV
A6
8-XI
29-XI
10-I
21-III
25-IV
Coordinador de las sesiones de laboratorio
Carlos García Ferris: Despacho 1207 situado en el 2º piso del edificio A de Biológicas.
Sesiones de aula
Las clases prácticas de aula consistirán en problemas y cuestiones sobre disoluciones tampón además
de otros relativos a los diferentes apartados recogidos en el programa de teoría. Estas clases se realizarán en
dos grupos de unos 50 estudiantes durante 10 sesiones de 1 hora cada una. El calendario previsto de las
sesiones de aula es:
Sesiones
Disoluciones tampón (1, 2 y 3)
Propiedades péptidos y proteínas (4)
Enzimología (5, 6 y 7)
Bioenergética (8, 9 y 10)
Grupo AP1
20-X, 27-X, 3-XI (8.30-9.30 h.)
10-XI (8.30-9.30 h.)
24-XI, 1-XII y 15-XII (8.309.30 h.)
23-II, 9-III y 23-III (8.309.30 h.)
Grupo AP2
20-X, 27-X, 3-XI (9.30-10.30 h.)
10-XI (9.30-10.30h.)
24-XI, 1-XII y 15-XII (9.3010.30h.)
23-II, 9-III y 23-III (9.3010.30h.)
Las sesiones tendrán lugar los citados días en el aula AI-13 en los horarios indicados para cada
grupo.
Bibliografía de las clases prácticas
Alemany, M y Fonts, S. (1983) Prácticas de Bioquímica. Ed. Alhambra.Madrid
Cárdenas,J. et al. (1988) Problemas de Bioquímica. Ed.Alhambra. Madrid
Ver referencias adicionales en el apartado correspondiente del Cuaderno de Problemas y Cuestiones.
Evaluación de la asignatura
Se realizarán exámenes escritos que consistirán en la resolución de cuestiones cortas y problemas
sobre los temas tratados durante las clases teóricas y las prácticas, tanto en el laboratorio como en el aula.
La calificación global máxima de 10 puntos corresponderá a teoría (8 puntos) y a prácticas (2 puntos
= 1 punto de los problemas en aula + 1 punto de las sesiones de laboratorio).
También se tendrá en cuenta la presentación de la reseña de alguno de los libros que la profesora
recomendará leer, así como la realización de algún trabajo y presentación del mismo en el aula, sobre alguno
de los temas que proponga la profesora.
La puntuación de teoría (8 puntos) podrá obtenerse examinándose parcialmente de la asignatura, de
manera que se distribuirá entre un primer parcial (4.0 puntos), y un segundo parcial (4.0 puntos). El examen
del primer parcial será relativo a los apartados I, II, y III del programa de teoría. Este examen será
eliminatorio a partir de 2.0 puntos (sobre 4.0). El examen del segundo parcial será relativo a los apartados IV
y V del temario. Para aprobar la asignatura es necesario sacar, en todas y cada una de las partes de teoría
(apartados I, II, III, IV y V), al menos un 20% de la calificación máxima de la parte correspondiente
La puntuación de prácticas se obtendrá mediante la evaluación de los contenidos de las sesiones de
aula (1 punto) y de los contenidos de las sesiones prácticas de laboratorio (1 punto) mediante sendos
exámenes escritos que se realizarán al finalizar las sesiones correspondientes de laboratorio.Para aprobar la
asignatura es necesario aprobar cada una de las dos partes prácticas.
Los estudiantes repetidores del Plan 2000, que hayan obtenido en la parte de laboratorio una
calificación igual o superior a 0.5, quedan dispensados, si lo desean, de la realización de este examen en el
curso 2005-2006.
Los estudiantes repetidores que provengan del Plan 93, y que tengan aprobado el módulo teórico o el
módulo práctico, podrán convalidar la nota previa presentación a la profesora de la asignatura de un
certificado de las calificaciones (una copia informativa es suficiente).
Fechas previstas de los exámenes:




Primer parcial: 9 de Febrero de 2007. (tarde)
Problemas y Laboratorio: 12 de Mayo de 2007 (sábado, mañana)
Segundo Parcial y Final: 11 de Junio de 2007 (tarde)
Septiembre (Examenes de Teoría,Problemas y Laboratorio): 6 de Septiembre de 2007
(mañana)
Correo electrónico: [email protected]