Guia_yCalendario_2007 - Biología Celular

Anuncio
Biología Celular 2007
Curso de Biología Celular
Material de apoyo para las clases de
Bioquímica:
Calendario
Objetivos docentes
Guía para discusiones grupales
Seminarios
Departamento de Bioquímica
Facultad de Medicina
2007
1
Biología Celular 2007
TEÓRICOS Y DISCUSIONES GRUPALES
Mar 18/9 Teórico:Enzimas (1:30hs)-Discusión Grupal (1:30 hs)
Mie 19/9 Discusión grupal (3 hs)
Jue 20/9 Teórico: Bioenergética (1:30hs)-Discusión grupal (1:30 hs)
Vie 21/9 Feriado universitario
Lun 24/9 Teórico: Introducción al metabolismo (1:30 hs)- Discusión Grupal (1:30 hs)
Mar 25/9 Discusión grupal (3 hs)
Mie 26/9 Teórico: Glucólisis (1:30 hs)- Discusión grupal (1:30 hs)
Jue 27/9 Teórico: Proliferación celular. Modelos (Biofísica)(1:30hs)- Discusión
Grupal (1:30 hs)
Vie 28/9 Seminario 1
Lun 1/10 Teórico: Ciclo de Krebs (1:30 hs)
Mar 2/10 Discusión grupal (3 hs)
Mie 3/10 Teórico: Cadena Respiratoria- Fosforilación Oxidativa(1:30 hs)
Jue 4/10 Discusión grupal (3 hs)
Vie 5/10 Seminario 2: Análisis de resultados experimentales: OXPHOS
Lun 8/10 Teórico: Vía de las Pentosas y Gluconeogénesis (1:30 hs) Discusión grupal
(1:30 hs)
Mar 9/10 Discusión grupal (3 hs)
Mie 10/10 Degradación y síntesis de ácidos grasos (1:30 hs)
Jue 11/10 Discusión grupal (3 hs)
Vie 12/10 Teórico: Integración del Metabolismo (1:30 hs)
Lun 15/10 Feriado
Mar 16/10 Discusión grupal. (3 hs)
Mie 17/10 Bioquímica del flujo de la información genética (1:30 hs)
Jue 18/10 Discusión grupal.
Vie 19/10 Seminario 3.
Lun 22/10 Teórico: Bases Bioquímicas de la traducción. Modificaciones post traduccionales (1:30
hs)
Mar 23/10 Discusión grupal (3 hs)
Mie 24/10 Traducción y plegamiento proteico. Degradación proteica: el proteasoma.
Jue 25/10 Discusión grupal 3 hs)
Vie 26/10 Seminario 4
Lun 27/10 Discusión grupal (3hs)
2
Biología Celular 2007
Horarios de Clases Prácticas para los Grupos 1, 2, 3 y 4
13:00 a 15:30 hs.
Sub
Grupos
1A
1B
2A
2B
3A
3B
4A
4B
Día 1
Día 2
Día 3
Día 4
Biofísica Bioquímica Bioquímica Bioquímica
Lu 1/10
Ma 2/10
Mie 3/10
Jue 4/10
Vie 5/10
Lun 8/10
Mar 9/10 Mie 10/10
Jue 11/10
Vie 12/10
Ma 16/10 Mie 17/10
Jue 18/10
Vie 19/10
Lu 22/10
Ma 23/10
Mie 24/10
Jue 25/10
Vie 26/10
Lu 29/10
Ma 30/10
Lu 5/11
Ma 6/11
Mie 7/11
Jue 8/11
Vie 9/11
Lu 12/11
Ma 13/11
Mie 14/11
Jue 15/11
Vie 16/11
Lu 19/11
Horarios de Clases Prácticas para los Grupos 5, 6, 7 y 8
9:30 a 12:00 hs.
Sub
Grupos
5A
5B
6A
6B
7A
7B
8A
8B
Día 1
Día 2
Día 3
Día 4
Biofísica Bioquímica Bioquímica Bioquímica
Lu 1/10
Ma 2/10
Mie 3/10
Jue 4/10
Vie 5/10
Lun 8/10
Mar 9/10 Mie 10/10
Jue 11/10
Vie 12/10
Ma 16/10 Mie 17/10
Jue 18/10
Vie 19/10
Lu 22/10
Ma 23/10
Mie 24/10
Jue 25/10
Vie 26/10
Lu 29/10
Ma 30/10
Lu 5/11
Ma 6/11
Mie 7/11
Jue 8/11
Vie 9/11
Lu 12/11
Ma 13/11
Mie 14/11
Jue 15/11
Vie 16/11
Lu 19/11
Horarios de Clases Prácticas para los Grupos 9, 10, 11 y 12
16:00 a 18:30 hs.
Sub
Grupos
9A
9B
10 A
10 B
11 A
11 B
12 A
12 B
Día 1
Día 2
Día 3
Día 4
Biofísica Bioquímica Bioquímica Bioquímica
Lu 1/10
Ma 2/10
Mie 3/10
Jue 4/10
Vie 5/10
Lun 8/10
Mar 9/10 Mie 10/10
Jue 11/10
Vie 12/10
Ma 16/10 Mie 17/10
Jue 18/10
Vie 19/10
Lu 22/10
Ma 23/10
Mie 24/10
Jue 25/10
Vie 26/10
Lu 29/10
Ma 30/10
Lu 5/11
Ma 6/11
Mie 7/11
Jue 8/11
Vie 9/11
Lu 12/11
Ma 13/11
Mie 14/11
Jue 15/11
Vie 16/11
Lu 19/11
3
Biología Celular 2007
Bioenergética y Enzimas
(Martes 18/09/07 al jueves 20/09/07)
Objetivos de aprendizaje
1- La célula como un sistema termodinámico: Sistema, entorno y universo. Primera y segunda ley de
la termodinámica. La energía libre como energía capaz de efectuar trabajo (G =H - TS). Relación
entre el equilibrio y la energía libre estándar (Go = -RTlnKeq).
2- Termodinámica de las reacciones catalizadas por enzimas. Energía libre de activación y efecto
de catalizadores, G de activación. Ley de acción de masas, orden de una reacción. Teoría del estado
de transición.
3- Cinética enzimática. Cinética química. Definición de enzima. Formación del complejo enzimasustrato. Ecuación de Michaelis-Menten. Significado de Vm, Km, Ks y constante catalítica. Efecto del
pH y la temperatura sobre la actividad enzimática. Gráfico de doble recíprocas: determinación de Vm y
Km. Inhibidores.
4- Control de la Actividad Enzimática: Modulación alostérica, covalente y mediada por proteólisis.
Enzimas alostéricas: velocidad en función de concentración de sustrato, efecto homotrópico y
heterotrópico.
.
Preguntas y Problemas para la Discusión en Grupos
1- Calcule la variación de energía libre de hidrólisis del ATP a pH 7 y 25 oC bajo condiciones de estado
estacionario (tal como existen en las células), en las cuales las concentraciones de ATP, ADP y Pi son
mantenidas en 1.0 mM, 0.1 mM y 10 mM, respectivamente.
2- La variación de energía libre estándar de la hidrólisis de ATP a 25 oC y pH 7 es -7.7 kcal/mol. Se
sabe que la variación de la energía libre estándar de la hidrólisis de glucosa-6-fosfato en las mismas
condiciones es -3.13 kcal/mol. Calcule la variación de energía libre estándar para la reacción que
cataliza la hexoquinasa:
GLUCOSA + ATP  GLUCOSA-6-P + ADP
3- Saccharomyces cereviseae (levadura) es un organismo eucariótico unicelular que se caracteriza por
tener como principal ruta catabólica la fermentación alcohólica. En esta vía la glucosa se degrada hasta
etanol y anhídrido carbónico:
Glucosa
 2Etanol + 2CO
2
Go = - 47 kcal/mol
a) ¿Qué tipo de sistema termodinámico es la levadura: cerrado, abierto o aislado?
4
Biología Celular 2007
b) ¿Qué cosas necesita la levadura del entorno y cuáles son eliminadas hacia el entorno?
c) ¿En qué se utiliza la energía libre de la fermentación alcohólica?
d) ¿Cuántos moles de ATP se forman por mol de glucosa oxidado a etanol y CO2 en condiciones
estándar?
e) En estado estacionario las levaduras tiene una concentración de glucosa de 5 mM y de etanol y
dióxido de carbono de 50 y 5 M, respectivamente. Las concentraciones de ATP, ADP y Pi son
mantenidas en 1.0 mM, 0.1 mM y 10 mM, respectivamente.
¿Cuántos moles de ATP se pueden formar por mol de glucosa oxidado en estas condiciones?
4- Representamos la energía libre de la isomerización de la glucosa 6 fosfato (G-6-P) en fructosa 6
fosfato (F-6-P) catalizada por la glucosa-fosfato isomerasa:
G-6-P
F-6-P
G
(kCal)
F-6-P:
0
0,34
0,5
1
G-6-P:
1
0,66
0,5
0
a) Utilizando el gráfico, calcule la constante de equilibrio, Keq, y Gº para la reacción
descrita,
considerando la temperatura como 25ºC.
b) Si se tienen iguales cantidades de G-6-P y F-6-P y se agrega la enzima, ¿hacia donde se desplaza la
reacción?
c) ¿Cuál será el G real de esta reacción en la célula si las concentraciones intracelulares medidas en
estado estacionario de G-6-P y F-6-P son de 83 y 14 M respectivamente?
5El paso a través de la membrana de compuestos polares es posible gracias a la presencia de
proteínas transportadoras en la membrana. La glucosa ingresa a las células a través de transportadores
específicos denominados GLUT. Considerando que la concentración plasmática de glucosa es de 5 mM
y la intracelular es 0.15 mM, calcule la variación de energía libre de la entrada de glucosa al interior de
la célula. ¿Como se denomina este proceso?
5
Biología Celular 2007
6El costo energético de transportar iones a través de una membrana depende en parte de la
diferencia de potencial eléctrico entre ambas caras de la membrana. Calcule la variación de energía
libre de la salida de Ca2+ desde el interior de la célula hacia el medio extracelular, considerando los
siguientes datos: [Ca2+] intracelular: 0.1 μM, [Ca2+] extracelular: 3 mM, el potencial de membrana de la
membrana plasmática de -50 mV, a 37ºC. Explique como ocurre y como se denomina este proceso.
7- Dada la siguiente reacción:
k1
k2
E + S  ES  E + P
k-1
Siendo k1 = 1 x 107 M-1s-1, k-1 = 1 x 102 s-1 y k2 = 3 x 102 s-1
Calcular:
a) Ks
b) Km
c) ¿Cuándo Ks se aproxima al valor de Km?
8- Considerando una enzima con cinética Michaeliana, ¿qué fracción de Vmax se observa cuando [S] = 2
Km, [S] = 6 Km, y [S] = 10 Km ?
9- Los siguientes resultados fueron obtenidos a partir de una reacción catalizada enzimáticamente:
[S] (mM)
v (mol/l/min)
0.50
8.0
0.75
10.0
1.00
11.4
1.50
13.0
2.00
15.0
a) Estimar gráficamente Vmax y Km
b) Estimar k2 (kcat) si la concentración de enzima fue de 8 nM
c)¿Cuál sería la velocidad de reacción a [S] = 600 M y a [S] 1200 M?
d) Estas velocidades de reacción fueron obtenidas en presencia de una concentración 8 x 10 -9 M de la
enzima. ¿Cuál sería la velocidad de reacción para [S] = 10 mM si la concentración de enzima hubiese
sido 1 x 10-8 M ?. Justifique su respuesta.
10- El sustrato de una enzima es el anión de un ácido débil A- (pKa=4.5). El sitio activo de la enzima
contiene un residuo de histidina (pKa=6.5) que tiene que estar protonado para la catálisis enzimática.
¿Cuál es la zona de pH óptimo de la reacción? Justifique su respuesta.
11- Un microgramo de una enzima pura (PM = 92.000) catalizó una reacción a una velocidad máxima
de 0.50 moles/min bajo determinadas condiciones de pH y temperatura.
Calcular:
a) Constante catalítica de la enzima (kcat)
b) ¿Cuánto dura un ciclo catalítico?.
6
Biología Celular 2007
12- Muchas reacciones enzimáticas se inhiben por el producto de la reacción. Utilizando los siguientes
datos de la inhibición causada por el acetaldehído sobre la oxidación del etanol catalizada por la
alcohol deshidrogenasa, determinar:
a) el tipo de inhibición que se produce
b) los valores de Km, Vmax y Ki.
Etanol (mM)
Acetaldehído (mM)
v (mol/min)
20.0
-
19.5
30.0
-
21.3
50.0
-
23.3
100.0
-
24.9
20.0
4.0
11.6
30.0
4.0
14.3
50.0
4.0
17.6
100.0
4.0
21.2
7
Biología Celular 2007
Introducción al Metabolismo Intermediario y Glucólisis.
(Lunes 24/09/07 al viernes 28/09/07)
Objetivos de aprendizaje
1- Metabolismo intermediario: Rutas centrales del metabolismo energético celular. Anabolismo y
catabolismo. Estructura y propiedades del ATP. Topografía del metabolismo: principales organelos y
compartimientos celulares, asociación de estructuras y funciones celulares.
3-Glucólisis: Localización subcelular, etapas, balance y regulación de la glucólisis. Destinos del
piruvato.
Seminario: Análisis de datos sobre la Fosfofructoquinasa.
Preguntas y Problemas para la Discusión en Grupos
1- La glucosa entra en la vía glucolítica por su fosforilación a glucosa-6-fosfato catalizada por dos
enzimas: la hexoquinasa, presente en todas las células (con un bajo Km para su sustrato) y la
glucoquinasa exclusiva del hígado pero con un alto Km para la glucosa.
a) ¿Cuáles son los posibles destinos de la glucosa 6-P en los distintos tejidos y frente a distintas
necesidades energéticas?
b) ¿Qué rol juega cada una de estas enzimas en el metabolismo de los carbohidratos?
c) Altos niveles de ATP y bajos de AMP inhiben a la fosfofructoquinasa. ¿Qué sucede con la
actividad de la hexoquinasa y glucoquinasa en esta situación?
2- Cada vez que una molécula de glucosa se transforma en dos moléculas de piruvato, ¿qué otras
moléculas consume y produce la célula? Plantee un balance.
3- Se determinaron los valores de variación de energía libre (G) para todas las reacciones de la
glucólisis en el músculo cardíaco. En la tabla se presentan estos valores y las variaciones de energía
libre estándar a pH 7 (Go’)
Reacción
1
2
3
4
5
6+7
8
9
10
Enzima
Hexoquinasa
Fosfoglucosa isomerasa
Fosfofuctoquinasa
Aldolasa
Trisoa fosfato isomerasa
Gliceraldehído-3-P DH + Fosfogliceratoquinasa
Fosfoglicerto mutasa
Enolasa
Piruvato quinasa
Go’ (kJ/mol)
-20.9
+2.2
-17.2
+22.8
+7.9
-16.7
+4.7
-3.2
-23.0
G (kJ/mol)
-27.2
-1.4
-25.9
-5.9
+4.4
-1.1
-0.6
-2.4
-13.9
a) ¿Qué reacciones se encuentran cercanas al equilibrio y cuáles se encuentran alejadas del
equilibrio, en el músculo cardíaco?
8
Biología Celular 2007
b) ¿Qué enzimas serían candidatas a controlar el flujo de metabolitos por la vía glicolítica? ¿Por
qué?
c) ¿Cómo se explica la diferencia de energía en condiciones estándar y fisiológicas, de la reacción
catalizada por la aldolasa?
10- La Piruvato quinasa cataliza la segunda reacción de formación de ATP de la glucólisis:
PEP + ADP
Piruvato
+ ATP
a) ¿Qué nombre recibe esta reacción de síntesis de ATP? ¿Qué otro mecanismo de síntesis de ATP
posee la célula?
b) El fosfoenolpiruvato tiene un Go’ de hidrólisis de –61.9 kJ/mol mientras que su precursor el 2fosfoglicerato tiene un Go’ de hidrólisis de –17.6 kJ/mol. Tomando en cuenta estos datos
discuta sobre el rol de la reacción catalizada por la enolasa.
11- El arsénico pentavalente o arsenato (HAsO42-) puede sustituir al fosfato (HPO42-) y formar ésteres
de arsenato que se hidrolizan espontáneamente. Su efecto se puede ilustrar en la reacción catalizada por
la gliceraldehído-3-P deshidrogenasa:
O
NAD+
HC
O
NADH
3OAsOC
OH
OH
3OPO2HC
HAsO42-
3OPO2HC
H2O
gliceraldehído-3-P
HAsO42-
O
-
OC
OH
3OPO2HC
3-fosfoglicerato
a) ¿Qué sucede con el consumo de glucosa frente al agregado de arsenato a un extracto de
levaduras?
b) ¿Cómo es el balance energético de la glucólisis en presencia de arsenato?
12- Se ha descubierto un mutante de un organismo anaerobio facultativo en el que la gliceraldehido-3fosfato deshidrogenasa cataliza la oxidación directa del gliceraldehido-3-fosfato a 3-fosfoglicerato sin
pasar por intermediario alguno. El mutante sobrevive en medio aerobio, pero no en medio anaerobio.
Explique las causas de este comportamiento.
9
Biología Celular 2007
13- A continuación se muestran las concentraciones intracelulares de los sustratos que intervienen en la
fosforilación de la fructosa-6-fosfato por la fosfofructoquinasa 1 (PFK-1) del tejido cardíaco de rata,
medidas por técnicas de criocompresión:
Metabolito
Fructosa-6-P
Fructosa-1,6-diP
ATP
ADP
Concentración (mM)
0.087
0.022
11.4
1.32
a) Calcular la relación de acción de masas: [F-1,6-diP][ADP]/[F-6-P][ATP]
b) Dado que el Go’= -14.2 kJ/mol, calcular la Keq.
c) Comparar la relación de acción de masas y la Keq.¿Se encuentra en equilibrio esta
reacción?¿Qué nos dice esto sobre el papel de la PFK1 como enzima reguladora?
14- Durante la actividad intensa el tejido muscular demanda altas cantidades de ATP comparado con el
tejido en reposo. Este proceso se produce casi exclusivamente por fermentación láctica y el ATP es
producido por las reacciones catalizadas por las enzimas fosfogliceratoquinasa y piruvato quinasa. ¿Si
el músculo esquelético fuera desprovisto de la enzima lactato deshidrogenasa podría llevar a cabo
actividad física intensa, es decir, generar ATP a alta velocidad por la glucólisis? Explique.
Seminario: Análisis de Datos Cinéticos de la Fosfofructoquinasa (PFK)
La PFK cataliza la fosforilación de la fructosa-6-fosfato (F-6-P) para formar fructosa-1,6-difosfato (F1,6-DP), en una reacción muy similar a la reacción de la hexoquinasa.
F-6-P

ATP
F-1,6-P

ADP
La PFK cataliza una reacción clave en la glucólisis. Se presentan a continuación datos experimentales
que ilustran su rol en la regulación de la vía glucolítica.
1- Cinética de la PFK en función de la concentración de ATP y F-6-P.
El ensayo cinético consistió en medir la desaparición de NADH (0.2 mM) a 340 nm en función del
tiempo en presencia de fructosa 6-fosfato, ATP, MgCl2, NADH y Pi, así como de las siguientes
enzimas acopladas: aldolasa, triosafosfato isomerasa y glicerol-3-fosfato deshidrogenasa. El ensayo fue
realizado a pH 7.0 con una concentración fija de F-6-P 2 mM o a una concentración fija de ATP 3
mM. En ambos casos se inició el ensayo con el agregado de 0.1 µg/ml de PFK.
10
Biología Celular 2007
a) Gráfico de v en función de [ATP] y [GTP] a una concentración fija de F-6-P
1- ¿Cual es la secuencia de reacciones en el ensayo acoplado para medir la velocidad de la PFK? ¿Por
qué se agrega MgCl2 en el ensayo enzimático?
2- Analice el diferente comportamiento de los sustratos ATP y GTP.
3- ¿Cual es la concentración intracelular de ATP en estado estacionario? ¿Cómo será la actividad de la
enzima en estas condiciones?
4- Si la concentración de ATP baja en la célula desde 2.5 mM a 1 mM, ¿qué sucede con la actividad de
la PFK?
b) Velocidad de la PFK en función de la concentración de F-6-P a una concentración fija de ATP (3
mM).
v (U/mg)
1.5
2
4.5
8.5
F-6-P (mM)
1
2
3
4
v (U/mg)
15
30
48
60
F-6-P (mM)
5
6
8
10
v (U/mg)
63
68
69
70
F-6-P (mM)
12
14
15
20
1unidad (U) es la cantidad de enzima que cataliza la transformación de 1µmol de sustrato por minuto.
11
Biología Celular 2007
1- Graficar velocidad en función de concentración de F-6-P.
2- ¿Cómo es la cinética de la PFK en función de F-6-P?¿Cómo es la unión de la F-6-P a la enzima?
¿Cuál es su K0.5?
3- ¿Cómo será la actividad de la PFK en condiciones celulares si la concentración de F-6-P en estado
estacionario es  0.1 mM?
2- Cinética de la PFK en presencia de citrato y AMP.
a) Efecto del AMP
¿Cuál es el efecto de AMP sobre la cinética de la PFK? ¿Cuál es la concentración de AMP intracelular
en estado estacionario?
b) Efecto del citrato
Citrato (mM)
0
F6P (mM)
2
4
6
8
10
12
14
16
20
25
30
0.2
1
5
0.5
1
8
18
30
45
58
62
65
66
-
0.2
0.45
2
3
8
10
18
28
45
55
60
v (U/mg)
2
8
25
50
65
69
70
72
-
1.8
7.5
20
42
60
65
69
70
-
12
Biología Celular 2007
1- Graficar velocidad de la PFK en función de concentración de citrato.
2- ¿Cuál es el efecto del citrato sobre la cinética de la PFK?
3- Sabiendo que la PFK es una enzima tetramérica formada por subunidades idénticas, plantea un
mecanismo cinético de la PFK utilizando el modelo simétrico de Monod, Wyman y Changuex (MWC).
4- En las células hepáticas, ¿cuál es el principal modulador alostérico de la PFK?
Ciclo de Krebs. Cadena respiratoria y fosforilación oxidativa. Utilización
de la energía celular.
(lunes 01-10- 07 al viernes 05-10-07)
Objetivos de aprendizaje
1. Ciclo de Krebs. Localización subcelular del Ciclo de Krebs. Panorámica general del ciclo.
Decarboxilaciones oxidativas: isocitrato deshidrogenasa y -cetoglutarato deshidrogenasa.
Fosforilación a nivel de sustrato: succinil-CoA sintetasa. Balance energético del ciclo.
Regulación del ciclo. El ciclo de Krebs como ruta anabólica y reacciones anapleróticas.
2. Reacciones de oxidación-reducción: Potencial redox estándar. Cambios de energía libre en las
reacciones de oxidación reducción (Go = - nFEo).
3. Cadena Respiratoria. Componentes de la cadena de transporte de electrones: flavoproteínas,
citocromos, ferro-sulfo proteínas y coenzima Q. Secuencia del transporte de electrones:
complejos de la cadena respiratoria. Ingreso de electrones a la cadena respiratoria. Lanzaderas
para el ingreso del NADH.
4. Fosforilación oxidativa. Síntesis de ATP acoplado al flujo de electrones. Hipótesis
quimiosmótica: generación del gradiente de protones. Mecanismo de la síntesis de ATP;
estructura de la ATPasa. Desacoplamiento de la fosforilación oxidativa e inhibidores. Balance y
regulación global. Índice P/O.
5. Utilización del ATP por la célula: transporte de metabolitos a través de membranas, trabajo
mecánico y síntesis de biomoléculas.
Seminario: Problema Básico clínico: Análisis de la historia clínica de un niño con una patología
mitocondrial (patologías OXPHOS).
Preguntas y Problemas para la Discusión en Grupos
1- La formación de acetil-CoA a partir de piruvato es una decarboxilación oxidativa catalizada por el
complejo piruvato deshidrogenasa.
a) ¿Cuáles son los componentes del complejo y qué reacciones catalizan?
b) ¿Cuál es el sustrato oxidado y cual el reducido?
c) ¿En qué compartimiento subcelular ocurre la decarboxilación oxidativa del piruvato?
13
Biología Celular 2007
2- El Ciclo de Krebs cataboliza el Acetil- CoA:
a) Escriba una ecuación equilibrada que describa la reacción catalizada por cada enzima del ciclo
b) ¿Qué cofactores son necesarios para cada reacción?
c) Identifique qué tipo de reacción cataliza cada enzima: condensación (formación de enlace CC), deshidratación, hidratación, descarboxilación, óxido-reducción, fosforilación a nivel de
sustrato.
d) Escriba la ecuación que describe la oxidación de Acetil-CoA a CO2. (Balance global del Ciclo).
3- En los experimentos que permitieron dilucidar el ciclo del ácido cítrico, Krebs observó que la
adición de malonato a extractos de músculo esquelético de paloma inhibe la utilización de piruvato y
provoca la acumulación de succinato.
a. ¿Por qué cree que Krebs utilizó preparaciones del músculo del vuelo de paloma en sus estudios?
b. ¿Por qué inhibe el malonato?
c. ¿Qué fue capaz de concluir cuando encontró que se acumulaba el succinato en las preparaciones
tratadas con malonato, luego de la adición de citrato, isocitrato o α-cetoglutarato?
d. ¿Por qué fue también significativa la acumulación de succinato en las preparaciones tratadas con
malonato cuando el sustrato añadido era fumarato, malato u oxalacetato?
4- Los enfermos de Beri-beri, enfermedad ocasionada por un déficit de tiamina en la dieta, tienen
niveles sanguíneos de piruvato y - cetoglutarato elevado, en especial después de comidas ricas en
glucosa. ¿Qué relación existe entre esos efectos y el déficit de tiamina?
5- Existen vías metabólicas que consumen intermediarios del Ciclo de Krebs. Un ejemplo es la síntesis
del neurotransmisor ácido -aminobutárico (GABA) a partir de glutamato en el tejido nervioso.¿A
partir de que intermediario del ciclo se sintetiza el neurotransmisor? ¿Cómo se repone el intermediario
para que el ciclo siga funcionando?
6- El dinucleótido de adenina y nicotinamida (NAD+) es la principal molécula transportadora de
electrones a nivel celular que luego puede cederlos a la cadena respiratoria y de este modo al oxígeno.
Dadas las siguientes semi-reacciones y sus potenciales redox estándar (Eº):
NAD+ + 2H+ + 2e-  NADH + H+ Eº = - 0.315 V
½ O2 + 2H+ + 2e-  H2O
Eº = 0.815 V
a) Si el par NAD+/NADH y el par ½ O2/H2O reaccionan directamente en condiciones estándar
¿quién se lleva los electrones, es decir quién es el agente oxidante? Plantee la reacción global y
determine la variación de energía libre.
b) ¿Cuántos moles de ATP se podrían formar por mol de NADH oxidado en esta reacción?
¿Coincide este dato con lo que ocurre en la cadena respiratoria?
7- Un mitoplasto es una mitocondria sometida a permeabilización con detergentes de forma que se le
extrae selectivamente la membrana externa. Por lo tanto, la cadena respiratoria y fosforilación
oxidativa no se alteran. Si a un mitoplasto (mitocondria sin membrana externa) se le elimina el
citocromo c por extracción salina dejando intactos el resto de los componentes y luego se le adicionan
sustratos generadores de NADH y succinato:
14
Biología Celular 2007
a) ¿Cuál será el estado redox de la NADH deshidrogenasa, succinato deshidrogenasa, CoQ, Cit b y a?
b) ¿Consume O2? Justifique su respuesta.
8- -¿Cómo entran a la cadena respiratoria los equivalentes de reducción provenientes de: glucólisis, oxidación y Ciclo de Krebs?
9- En 1961 Mitchell desarrolló la denominada hipótesis quimiosmótica para explicar la génesis
mitocondrial de ATP. Postuló que la energía libre del transporte mitocondrial de electrones es
conservada “bombeando” H+ desde la matriz mitocondrial al espacio intermembranoso, creándose así
un gradiente electroquímico de protones a través de la membrana mitocondrial interna. El retorno
exergónico de los protones a la matriz mitocondrial impulsa la síntesis de ATP, es decir que el
potencial electroquímico de dicho gradiente es utilizado para sintetizar ATP.
a) Indique las principales observaciones experimentales que sustentan dicha hipótesis.
b) Sabiendo que el potencial de membrana a través de la MMI de una mitocondria de hígado es
0.168 V (interior negativo) y el gradiente de pH 0.75 (pH matriz – pH espacio
intermembranoso), calcule el G asociado al transporte de 1 mol de protones hacia afuera de la
matriz mitocondrial.
c) Si las concentraciones intracelulares en estado estacionario de ATP, ADP y Pi son 5, 0.5 y 1
mM respectivamente, ¿la reentrada de 1 protón a la matriz mitocondrial es suficiente para
impulsar la síntesis de ATP?
10- Mucha de la información acerca de la cadena respiratoria se obtuvo utilizando inhibidores, los
cuales pueden ser inhibidores de la cadena respiratoria, inhibidores de la fosforilación oxidativa y
desacoplantes, ¿cuál es la diferencia entre ellos y a qué nivel actúan?
15
Biología Celular 2007
Seminario: Análisis de las bases moleculares de una patología OxPhos
Un niño que nació luego de 40 semanas de gestación desarrolló en las primeras 24 horas de vida
problemas respiratorios y a las 6 semanas problemas neurológicos y cardíacos, revelando los exámenes
la existencia de una miocardiopatía. Entre las 15 y las 16 semanas se detectó además una acidemia
láctica progresiva, con un valor de pH de 7.30 (rango normal 7.38-7.44), con valores de piruvato y de
la relación lactato / piruvato elevados.
La acidemia láctica persistió hasta que el niño murió de un paro cardio respiratorio a las 16 semanas de
vida.
A fin de comprender las bases moleculares de la patología que provocó la muerte de este niño se evaluó
la funcionalidad de las vías del metabolismo energético en el tejido cardíaco:
 Las actividades de las enzimas de la vía glucolítica y de la piruvato deshidrogenasa eran
normales.
 Estudios de resonancia paramagnética de electrones (EPR) indicaron que el contenido de hierro
de las mitocondrias era menor al normal y lograron identificar qué tipo de grupo prostético se
hallaba afectado.
 Se purificaron mitocondrias de músculo cardíaco y se valoró su funcionalidad:
La gráfica A presenta el consumo de oxígeno mitocondrial en función del tiempo en presencia de
piruvato y malato, antes y después de agregar 7.2 µmoles de ADP
La gráfica B presenta el consumo de oxígeno mitocondrial en función del tiempo en presencia de
succinato antes y después de agregar 7.2 µmoles de ADP.
Piruvato/Malato
A
ADP
Succinato
B
ADP
1 mol
de O2
1 min
a) ¿Qué conclusiones pueden sacar con respecto a la funcionalidad mitocondrial del tejido cardíaco de
este niño?
16
Biología Celular 2007
b) Diseñe un esquema que presente las principales vías metabólicas mitocondriales y contenga a los
principales complejos enzimáticos. A partir de los datos obtenidos con las mitocondrias plantee a
que nivel podríamos encontrar un defecto en el metabolismo mitocondrial.
c) A partir de los datos de EPR plantee que cofactor o grupo prostético se encuentra afectado.
d) ¿Estas mitocondrias se encuentran desacopladas? ¿Son capaces de sintetizar ATP?
e) ¿Cuál es la relación P/O con succinato? ¿Es la esperada? ¿Se puede calcular la relación P/O con
piruvato/malato?
f) ¿Cómo puede explicar la debilidad muscular y los problemas neurológicos del niño tomando en
cuenta los datos aportados?
g) La enfermedad de este niño se encuentra dentro del grupo de las acidosis lácticas congénitas.
¿Porqué? ¿A que se debe el aumento del ácido láctico en sangre?
h) Las enfermedades que involucran a componentes de la cadena respiratoria y la fosforilación
oxidativa se conocen como enfermedades OXPHOS, y se encuentran entre las enfermedades
degenerativas más comunes. Algunos de los componentes de la cadena respiratoria y la
fosforilación oxidativa son codificados por el ADN mitocondrial: 7 subunidades del complejo I, 1
subunidad del Complejo III, 3 subunidades del complejo IV y 2 subunidades del complejo ATP
sintasa. El resto son codificados por el ADN nuclear.
 Plantee una hipótesis sobre la causa de la enfermedad de este niño y que experimentos
realizaría para probarla.

La mayoría de los casos reportados hasta el momento se deben a fallas en los componentes
codificados por el ADN mitocondrial. ¿A qué puede deberse esto?
17
Biología Celular 2007
Ruta de las Pentosas-fosfato y Gluconeogénesis.
(lunes 08-10-07 al martes 09-10-07)
Objetivos de aprendizaje
1- Ruta de las pentosas fosfato: Etapa oxidativa y no oxidativa, regulación y balance de la ruta de las
pentosas fosfato. Utilización del NADPH y de la ribosa 5 fosfato por la célula.
2- Gluconeogénesis. Reacciones de la gluconeogénesis. Relación con la glucólisis. Balance
regulación.
y
Preguntas y Problemas para la Discusión en Grupos
1- Explicar el destino metabólico de la glucosa 6-fosfato bajo cada una de las siguientes condiciones:
a) las necesidades de NADPH son mayores que las de ribosa 5-fosfato
b) las necesidades de ribosa 5-fosfato son mayores que las de NADPH
c) las necesidades de ribosa 5-fosfato y de NADPH son del mismo orden.
2- Se realizó un estudio sobre los niveles de actividad de enzimas del metabolismo de la glucosa en los
eritrocitos. Se estudio una población de 100 individuos sanos de características comparables (edad,
peso). En 3 de ellos se detectó una actividad de la enzima glucosa –6-fosfato deshidrogenasa 10 veces
menor a la del resto de los individuos.
a) ¿Cómo serán los niveles de ATP, NADH y NADPH de estos individuos comparados con el resto?
b) ¿Cómo puede afectar esto al eritrocito y su función?
c) Si la actividad glucosa-6-fosfato deshidrogenasa se encontrara disminuida en otros tejidos ¿qué vías
metabólicas podrían estar afectadas?
3- Por cada glucosa 6-P que es completamente oxidada a CO2 por la ruta de las pentosas, ¿cuál es el
rendimiento en NADPH? ¿En qué tejidos espera encontrar un mayor consumo de glucosa por esta ruta?
4- El músculo esquelético libera grandes cantidades de alanina (Ala) y lactato en distintas condiciones
metabólicas. A nivel hepático éstos son captados y utilizados para formar glucosa, la que es entonces
liberada desde el hígado al torrente sanguíneo.
a) ¿Qué reacciones sufren la Ala y el lactato para superar las etapas fuertemente exergónicas de la
glucólisis y formar glucosa?
b) ¿En qué compartimentos se produce este proceso?
c) Señale en que etapas se podrían producir ciclos fútiles. ¿Cuál sería el efecto a nivel celular de tales
ciclos y cómo se evitan?
5- A partir de hígado de rata se obtuvieron, por centrifugación diferencial fracciones subcelulares
enriquecidas en: núcleo, mitocondrias, fragmentos de membrana (retículo y membrana plasmática) y
citosol. Se determinó la actividad de las enzimas de la gluconeogénesis en las distintas fracciones
a) ¿Que actividades se encontrarán en las distintas fracciones?
18
Biología Celular 2007
b) Si agregamos oxalacetato y ATP marcado con fósforo radioactivo a la fracción citosólica ¿Qué
metabolitos marcados con fósforo se acumularán?
c) Si agregamos oxalacetato y ATP marcado a la fracción mitocondrial ¿Qué metabolitos marcados se
acumularán?
d) Si realizamos el mismo proceso de obtención de fracciones subcelulares a partir de músculo
esquelético ¿obtendremos las mismas actividades enzimáticas en las mismas fracciones?
Síntesis y degradación de los Ácidos Grasos.
Integración del metabolismo.
(miércoles 10-12-07 al martes 16-10-07)
Objetivos de aprendizaje
1- Síntesis de ácidos grasos. Etapas de la síntesis de ácidos grasos (acetil-CoA carboxilasa y complejo
ácido graso sintasa). Localización subcelular, regulación y balance. Reacciones de elongación e
insaturación de ácidos grasos. Almacenamiento de ácidos grasos como triacilglicéridos.
2- Oxidación de ácidos grasos: Localización subcelular. Órganos que obtienen su energía
predominantemente por esta ruta. Etapas: Activación de ácidos grasos, transporte a través de la
membrana mitocondrial interna, -oxidación propiamente dicha: ruta de los carbonos y de los
electrones. Balance global y regulación.
3- Metabolismo intermediario e integración del metabolismo. Naturaleza convergente del
catabolismo y divergente del anabolismo. Glucosa-6-fosfato, piruvato y acetil-CoA como encrucijadas
metabólicas. Roles del ATP, NADH Y NADPH. Acción coordinada de las rutas metabólicas en
distintas situaciones celulares. Roles de la compartimentalización y la regulación coordinada de las vías
de producción y almacenamiento de energía. Especialización metabólica de los distintos órganos
Seminario: Problema básico-clínico: Análisis de las bases moleculares de la intoxicación alcohólica.
Preguntas y Problemas para la Discusión en Grupos
1- A una fracción soluble de hígado se le agrega [14C]acetil-CoA (marcada radiactivamente en todos
los carbonos) resultando en la formación de ácido palmítico con todos los carbonos marcados. Sin
embargo si al mismo preparado de hígado se le agregan pequeñas cantidades de [ 14C]acetil-CoA y un
exceso de malonil-CoA sin marcar, obtenemos ácido palmítico marcado solamente en los carbonos 15
y 16.
Utilizando sus conocimientos sobre las síntesis de ácidos grasos explique estas observaciones.
2- Plantee la ecuación de la síntesis de ácido palmítico en el hígado de la rata a partir de acetil CoA
mitocondrial, NADPH citosólico, ATP y CO2.
3- ¿Cuál sería el efecto sobre la síntesis de ácidos grasos de un aumento de la concentración
intramitocondrial de oxalacetato?
19
Biología Celular 2007
4- Franz Knoop en 1904 propuso el nombre de -oxidación para el proceso biológico de oxidación de
ácidos grasos, mucho antes que se conociera la CoA y las enzimas involucradas (descubrimiento que
ocurre por 1950). Knoop alimentó perros con ácidos grasos modificados en el último carbono, llamado
carbono , con un anillo de benceno. Utilizó dos tipos de ácidos grasos: con número par de carbonos y
con número impar. Aisló de la orina de los perros los productos que poseían un grupo fenilo. Los
perros alimentados con ácidos grasos de número impar originaron ácido benzoico. Los perros
alimentados con ácidos grasos de número par produjeron en su orina ácido fenilacético:
COOH
COOH
ácido fenilacético
COOH
COOH
ácido benzoico
a) ¿Por qué ambos grupos de perros no originaron el mismo producto final, ácido benzoico o
fenilacético?
b) ¿Por qué Knoop utilizó el nombre de -oxidación?
c) ¿Cómo son la mayoría de los ácidos grasos de la dieta, de número par o impar de átomos de
carbono? ¿Cuáles son los productos finales de oxidación para ambos casos?
5- Explique el rol de la carnitina acil transferasa en la compartimentalización de la -oxidación de los
ácidos grasos.
6- Los ácidos grasos son convertidos a sus ésteres de coenzima A por una reacción reversible catalizada
por la acil:coenzima A sintetasa:
R-COO- + ATP + CoA
R-CO- CoA + AMP + PPi
Si bien esta reacción posee una constante de equilibrio cercana a 1, la célula posee un mecanismo
que favorece la formación de acil-CoA. Explique.
7- En los últimos kilómetros de una maratón, los corredores obtienen la energía casi exclusivamente
por oxidación de los ácidos grasos y de algunos aminoácidos. Describa el mecanismo por el que se
detiene la oxidación de los ácidos grasos cuando los corredores descansan e ingieren una comida rica
en carbohidratos después de la maratón.
8- Durante el ayuno se hidrolizan triglicéridos presentes en el tejido adiposo. Los ácidos grasos viajan
por la sangre a los tejidos donde son oxidados en la mitocondria, produciendo grandes cantidades de
acetil CoA
a) ¿Qué ocurre en estas condiciones con la velocidad del flujo de metabolitos por el Ciclo del Ácido
Cítrico?
b) ¿Qué enzimas son responsables de esta variación en el flujo?
c) ¿Cuáles son los mecanismos de regulación de estas enzimas?
20
Biología Celular 2007
9- Es bien conocido que las dietas ricas en carbohidratos se asocian con aumento de peso debido
principalmente a un aumento del tejido adiposo.
a) Explique esquemáticamente el mecanismo por el cual la glucosa se transforma en ácidos grasos.
b) ¿En qué órgano se produce principalmente dicha reacción?
c) ¿Es posible sustituir totalmente los carbohidratos de una dieta por lípidos?
10- El consumo de glucosa por el músculo cardíaco puede ser medido haciendo circular artificialmente
sangre a través de un corazón intacto aislado y midiendo la concentración de glucosa antes y después
de que la sangre pase por el corazón. Si la sangre es desoxigenada, el músculo cardíaco consume
glucosa a un nivel estacionario. Cuando se adiciona oxígeno a la sangre, la velocidad de consumo de
glucosa cae dramáticamente y luego continúa a una velocidad menor. ¿Por qué?
11- Analice las similitudes y diferencias, estructurales y funcionales, del NADH y NADPH.
12- Plantee cuáles pueden ser los diferentes destinos metabólicos de la glucosa 6-fosfato, el piruvato y
la acetil CoA en un hepatocito, en condiciones de ayuno y después de una comida abundante.
Seminario: Análisis de las bases moleculares de la intoxicación alcohólica
Las células animales (principalmente los hepatocitos) contienen la enzima citosólica alcohol
deshidrogenasa (ADH) que cataliza la oxidación del etanol a acetaldehído. El acetaldehído entra a la
mitocondria donde es oxidado a acetato por la acetaldehído deshidrogenasa (AcDH).
CH3 – CH2 – OH + NAD+  CH3 – HCO + NADH
ADH
CH3 – HCO + NAD+  CH3 – COOH + NADH
AcDH
Los efectos metabólicos de la intoxicación con alcohol surgen de las acciones de estas dos enzimas que
llevan a un desbalance de la relación NADH/NAD+ en la célula. A continuación presentamos algunos
datos de la historia clínica de un paciente alcohólico, Alberto Martini, a fin de que sean analizados
desde una perspectiva molecular.
Alberto Martini es alcoholista, llegó a la emergencia del hospital confuso y tembloroso. Su vecina le
dijo al médico que había estado tomando mucho durante la última semana. En este tiempo su apetito
había disminuido y casi no había comido en los últimos tres días. Su nivel de glucosa en sangre era de
28 mg/dl (niveles normales luego del ayuno nocturno 80-100 mg/dl), y el de alcohol en sangre de 295
mg/dl (niveles de intoxicación 150-300 mg/dl). Los exámenes de laboratorio revelaron que tenía una
acidemia, acompañada de niveles altos del cuerpo cetónico ß-hidroxibutirato (40 veces mayores a los
normales) y de ácidos grasos en sangre. El análisis de acetona en orina dio negativo.
¿A que se deben los niveles bajos de glucosa en sangre del Sr Martini?
¿Cómo se encontrarán los depósitos de glucógeno hepático de Alberto Martini?¿Porqué?
¿Qué ocurrirá con la gluconeogénesis a partir de lactato, a partir de glicerol y a partir de oxalacetato?
¿Qué vías metabólicas utilizará Alberto Martini para la síntesis de ATP en cerebro y músculo?¿Qué
ocurrirá en el hígado?
21
Biología Celular 2007
¿A que se debe la presencia de niveles altos de ß-hidroxibutirato y de ácidos grasos en la sangre de
Alberto Martini?
¿A qué se debe la acidemia?
¿Cómo explica que el test de acetona en la orina diera negativo y que el cuerpo cetónico predominante
sea el ß-hidroxibutirato?
¿ Porqué es frecuente que los alcohólicos desarrollen depósitos de triglicéridos en el hígado (síndrome
de hígado graso)?
¿Qué vías metabólicas hepáticas serán inhibidas por este aumento de la relación NADH/NAD+? ¿Qué
enzimas serán responsables de esta inhibición?
Bioquímica del flujo de la información genética
(miércoles 17-10-07 al lunes 27-10-07)
Objetivos de aprendizaje
1- Metabolismo del ADN. Estructura de los ácidos nucleicos: generalidades. Enzimas modificadoras
del ADN. ADN polimerasas procariotas y eucariotas. Mecanismo molecular de la replicación.
Precisión de la replicación. Mecanismos de reparación.
2- Metabolismo del ARN. Síntesis de ARN. ARN polimerasas dependientes de ADN. Inicio de la
transcripción: promotores. Mecanismo molecular de la transcripción. Maduración del ARN. mARNs:
modificaciones 5’ y 3’, escisión y empalme (splicing). ARN polimerasas dependientes de ARN:
transcriptasa reversa.
3- Traducción, destino y degradación proteica. El código genético. El ribosoma: función de los
rARN y de los tARN. Aminoacil-tARN sintetasas. Etapas de la síntesis proteica: Inicio de la
traducción, elongación, terminación. Modificaciones post-traduccionales. Destino de las proteínas.
Degradación: ubiquitinas y el proteasoma.
Preguntas y Problemas para la Discusión en Grupos
1- 1- El experimento de Meselson y Stahl descarta un modelo de replicación conservativa. Explicar de
qué modo este experimento descarta un modelo de estas características y demuestra que la replicación
es semiconservativa.
2- Supongamos que la densidad de un DNA de doble hebra normal (con 14N) es de 1,670 y la de uno
marcado por completo con 15N es de 1,685. Un cultivo de células se cambia de medio normal a medio
con 15N. ¿Cuál será la densidad del DNA en la 3ª generación (tras 3 divisiones)?
22
Biología Celular 2007
3- ¿A qué se llama horquilla de replicación?
4- Indique qué especies moleculares son necesarias para la replicación.
5- Las DNA polimerasas avanzan por el DNA, sintetizando una nueva hebra, a la velocidad indicada en
la tabla (nucleótidos por segundo).
DNApol procarióticas
DNApol-I DNApol-II DNApol-III
16-20 nt/s
7 nt/s
250-1000 nt/s
DNApol eucariótica
100 nt/s
a) ¿Cuál es la velocidad de desplazamiento de cada especie de DNApol, en milímetros/hora.
b) ¿Cuánto tardaría una única molécula de DNApol en replicar un genoma de E. coli o humano?
(Genoma de E.coli: 4.7 Mb ; genoma humano: 6600 Mb)
6- Indique si son correctas o no las siguientes frases. Discuta su respuesta.
a) La tasa de errores en la replicación del DNA se ve reducida tanto por la corrección de pruebas de la
DNA polimerasa como por las enzimas reparadoras del DNA.
b) En ausencia de mecanismos de reparación del DNA, los genes serían inestables.
c) Los fragmentos de Okazaki son eliminados por una ribonucleasa.
7- Dado el siguiente sector de ADN, discuta que partes se replicarán en forma continua y cuales en
forma discontinua:
5’AGGTGCTGCTTAAGCCTGATAGCCTG3’
5’TCCACGTACGAATTCGGACTATCGGAC3’
23
Biología Celular 2007
8- ¿En qué etapa de la replicación intervienen las siguientes proteínas? ¿Hay alguna de ellas que no
participa en la duplicación?
iniciación elongación
maduración de los
terminación
fragmentos de Okazaki
topoisomerasas
TF II D
DNA polimerasa
RNA polimerasa
helicasa
proteína ro
proteínas de unión a hebra sencilla
primasa
eIF3
ribonucleasa FEN1 y RNasa H1
telomerasa
polinucleótido fosforilasa
ligasa
amanitina
9- ¿Cuáles son las principales similitudes y diferencias entre la ADN-polimerasa y la ARN polimerasa,
desde un punto de vista enzimático?
10- Indique qué tipo de secuencias promotoras conoce.
11- ¿Qué característica distingue a eucariotas y procariotas en la transición entre la iniciación y la
elongación de la transcripción?
12- ¿Qué es un intrón y dónde se encuentra?
13- Indique cuál es el número mínimo de reacciones de trans esterificación necesarios para cortar un
intrón y unir los exones adyacentes.
14-La especificidad de las aminoacil-tRNA sintetasas, que catalizan el proceso de activación de un
aminoácido (a aminoacil-tRNA), se ejerce en la primera de las etapas del proceso, la formación del
aminoacil-AMP. ¿Es esto correcto? Comentarlo.
24
Biología Celular 2007
15- La secuencia Kozak (en el mRNA de eucariotas) actúa como señal iniciadora de traducción. Se
aparea por tres de sus nucleótidos con el anticodón de primer aminoacil-tRNA (Met-tRNA), en
presencia de eIF-2 y GTP. ¿Es esto correcto?. Comentarlo.
16- En el proceso de traducción, ¿a qué se llama activación de un aminoácido? ¿Para qué aminoácidos
es necesaria?
17- ¿Qué se entiende por mARN monocistrónico y policistrónico?
18.-¿Cuál es el papel del péptido señal en la translocación de proteínas?
19.-¿Qué posibles destinos tienen las proteínas que se pliegan en el retículo endopolásmico?
20- ¿Por qué algunas proteínas se sintetizan como propéptidos?
21.- Liste las modificaciones post-traduccionales N-terminales que conozca
22.- Discuta el rol de las chaperonas en el plegamiento proteico
23.- Aunque la hidrólisis proteica es un proceso termodinámicamente favorable, la hidrólisis selectiva
de las proteínas marcadas con ubiquitina requiere ATP. Sugiera porque debe ser ello necesario.
24.- En la degradación de las proteínas por la ruta de la ubiquitina tan solo los pasos 1 y 4 dependen del
ATP. ¿Por qué estos dos pasos y no los otros?
25
Biología Celular 2007
Horarios de Clases Prácticas para los Grupos 1, 2, 3 y 4
13:00 a 15:30 hs.
Sub
Grupos
1A
1B
2A
2B
3A
3B
4A
4B
Día 1
Día 2
Día 3
Día 4
Biofísica Bioquímica Bioquímica Bioquímica
Lu 1/10
Ma 2/10
Mie 3/10
Jue 4/10
Vie 5/10
Lun 8/10
Mar 9/10 Mie 10/10
Jue 11/10
Vie 12/10
Ma 16/10 Mie 17/10
Jue 18/10
Vie 19/10
Lu 22/10
Ma 23/10
Mie 24/10
Jue 25/10
Vie 26/10
Lu 29/10
Ma 30/10
Lu 5/11
Ma 6/11
Mie 7/11
Jue 8/11
Vie 9/11
Lu 12/11
Ma 13/11
Mie 14/11
Jue 15/11
Vie 16/11
Lu 19/11
Horarios de Clases Prácticas para los Grupos 5, 6, 7 y 8
9:30 a 12:00 hs.
Sub
Grupos
5A
5B
6A
6B
7A
7B
8A
8B
Día 1
Día 2
Día 3
Día 4
Biofísica Bioquímica Bioquímica Bioquímica
Lu 1/10
Ma 2/10
Mie 3/10
Jue 4/10
Vie 5/10
Lun 8/10
Mar 9/10 Mie 10/10
Jue 11/10
Vie 12/10
Ma 16/10 Mie 17/10
Jue 18/10
Vie 19/10
Lu 22/10
Ma 23/10
Mie 24/10
Jue 25/10
Vie 26/10
Lu 29/10
Ma 30/10
Lu 5/11
Ma 6/11
Mie 7/11
Jue 8/11
Vie 9/11
Lu 12/11
Ma 13/11
Mie 14/11
Jue 15/11
Vie 16/11
Lu 19/11
Horarios de Clases Prácticas para los Grupos 9, 10, 11 y 12
16:00 a 18:30 hs.
Sub
Grupos
9A
9B
10 A
10 B
11 A
11 B
12 A
12 B
Día 1
Día 2
Día 3
Día 4
Biofísica Bioquímica Bioquímica Bioquímica
Lu 1/10
Ma 2/10
Mie 3/10
Jue 4/10
Vie 5/10
Lun 8/10
Mar 9/10 Mie 10/10
Jue 11/10
Vie 12/10
Ma 16/10 Mie 17/10
Jue 18/10
Vie 19/10
Lu 22/10
Ma 23/10
Mie 24/10
Jue 25/10
Vie 26/10
Lu 29/10
Ma 30/10
Lu 5/11
Ma 6/11
Mie 7/11
Jue 8/11
Vie 9/11
Lu 12/11
Ma 13/11
Mie 14/11
Jue 15/11
Vie 16/11
Lu 19/11
26
Biología Celular 2007
Bibliografía:
Bioquímica. Mathews – van Holde. ed. McGraw-Hill Interamericana, 1998.
Principios de Bioquímica. Lehninger, tercera edición, ed. Omega, 2001. (y ediciones anteriores) .
Bioquímica. Stryer L., quinta edición, ed. Reverté, 2003. (y ediciones anteriores) .
Bioquímica. Voet D, Voet JG. ed.Omega. 1992.
Sitio web: http://www.cecalc.ula.ve/bioinformatica/BIOTUTOR/ (parte de las preguntas de esta página
están incluídas en este cuestionario).
27
Descargar