PEDECIBA – AREA BIOLOGÍA SECC. GENÉTICA EVOLUTIVA – FACULTAD DE CIENCIAS CURSO: ORGANIZACIÓN, FUNCIÓN Y VARIABILIDAD DEL GENOMA Primer Semestre 2010 Coordinadora: Dra. Graciela García Martes y jueves: 15-17:30 hs. Salón de teórico: Salón 209 Módulo I. Organización y función del genoma Docentes participantes: Dr. Rúben Pérez Dra. Gabriela Bedó Dra. Yanina Panzera Dra. Adriana Parodi TEÓRICOS 13/04 Organización genómica I. Concepto de genoma. Variación del valor C y G (número de genes). Tipos de secuencias. Evolución de secuencias exónicas e intrónicas. Origen de los genes por duplicación. R. Pérez 15/04 Organización genómica II. Elementos transponibles: clasificación, evolución y efectos en el genoma hospedero. Secuencias satélite: micro, mini y macro satélites. Y. Panzera 20/04 Estrategias de estudio de genomas completos. Técnicas de secuenciación. Estrategias de secuenciación a gran escala. Ensamblado y mapeo de genomas. Análisis de secuencias. G. Bedó 22/04 Análisis de la función del gen. Genética inversa. Uso de transgénicos y ARN interferente. Análisis de la expresión génica (Transcriptoma y Proteoma). A. Parodi. PRÁCTICOS ACTIVIDADES DE BIOINFORMÁTICA Y LABORATORIO (R.Pérez, Y. Panzera, G.Bedó, A. Parodi). 27-29/ 04 Herramientas informáticas para el análisis de los genomas. Ensamblado, anotación y comparación de genomas. Ejemplos de genomas de virus, bacterias y eucariotas. 2 clases. Salones de informática. 4, 6, y 13/05 Amplificación por PCR de un genoma viral. Ensamblado, anotación y análisis de variantes. Análisis a nivel de ARN y proteínas. 3 clases. Salones de informática y laboratorios (5º piso). Módulo II. Introducción a la organización del genoma eucariota mediante estrategias genéticas de mapeo.(*) Docentes participantes: Dra. Beatríz Goñi Dra. Graciela García (*)Algunas clases prácticas se dictarán durante el horario del curso en los salones indicados. 11/05- Teórico. Introducción a los diferentes tipos de mapeo: genético, citogenético y físico. Marcadores fenotípicos-moleculares en la construcción de mapas genéticos. Diseños experimentales y tipos de cruzamientos. Caracteres discretos (o cualitativos). G. García Práctico Recombinación en Drosophila. Prueba de 3 puntos (I). Introducción y 1er cruzamiento (salón 306). B. Goñi 20/05- Teórico. Recombinación y mapeo genético en Drosophila melanogaster. Modificadores de la recombinación. B. Goñi 25/05- Teórico. Introducción a los cromosomas politénicos y su aplicación en el mapeo citogenético y estudios evolutivos. B. Goñi Práctico Recombinación en Drosophila. Prueba de 3 puntos (II). Observación progenie F1 y 2do cruzamiento (salón 306). B. Goñi Práctico Cromosomas politénicos (I). Disección glándulas salivares en Drosophila (salón 306). B. Goñi 27/05 Práctico. Cromosomas politénicos (II). Técnica del aplastado para observar los cromosomas gigantes en Drosophila spp. (salón 306). B. Goñi 01/06 . Práctico. Cromosomas politénicos (III). Identificación de los cromosomas. Observación de reordenamientos cromosómicos. Utilización del citomapa. (salón 306). B. Goñi 03/06 Teórico.- Mapas de ligamiento y asociación utilizando marcadores moleculares. Mapeo genómico de alta densidad. Herramientas estadísticas y de genética poblacional en el mapeo. G. García 08/06 Práctico Recombinación en Drosophila. Prueba de 3 puntos (III). Observación de la progenie F2. Determinación orden de los genes. Calculo de distancias genéticas. Discusión de los resultados. (salón 306). B. Goñi 10/06 Teórico- Mapeo de caracteres continuos (o cuantitativos) y rasgos de arquitectura compleja- QTLs (Quantitative Trait Loci). Aproximaciones al mapeo utilizando GWAS (Genome-Wide Association Studies). G. García 15/06 Teórico Integración entre mapas genéticos, citogenéticos y físicos. G. García 17, 22, y 24/06 - Prácticos. Construcción de mapas genómicos de alta densidad utilizando marcadores moleculares. Utilización de programas computacionales en la construcción de grupos de ligamiento. (salón a confirmar). G.García 29/06- Seminario I. B. Goñi 01/07- Seminarios II. G. García MODALIDAD DEL CURSO: 10 Clases teóricas (25 hs) Prácticos (30 hs) Seminarios de presentación de la actividad práctica (5 hs) COMIENZO: 13 de abril de 2010. DURACIÓN: Un SEMESTRE. Total de horas estimadas: 60 hs APROBACIÓN DEL CURSO: 75% de asistencia a las clases - Asistencia a toda la actividad práctica y participación obligatoria en los Seminarios. - Examen final: Evaluación escrita individual.