2014-II Ecología Microbiana - Facultad de Ciencias Biológicas

UNIVERSIDAD NACIONAL MAYOR DE SAN MARCOS.
FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS
ESCUELA ACADÉMICO PROFESIONAL DE MICROBIOLOGÍA Y
PARASITOLOGÍA
SYLLABUS.
SEMESTRE ACADÉMICO
I. DATOS GENERALES:
1.1. CURSO
1.2. CÓDIGO
1.3. CRÉDITOS
1.4. DURACIÓN
1.5. AÑO DE ESTUDIOS
1.6. NÚMERO DE HORAS
1.7. PRE-REQUISITO
1.8. HORARIO
: 2014 – II
: ECOLOGÍA MICROBIANA
: B03137
: 4,0
: agosto a diciembre del 2014
: 4° Año
: TEORÍA: 02 h; PRÁCTICAS: 04 h
: Ecología General, Bacteriología y Micología
: Teoría: miércoles, 14:00 a 16:00 h (Aula: 309)
Prácticas:
Grupo A: miércoles y viernes 16:00 a 18:00h
Grupo B: miércoles y viernes 18:00 a 20:00h
(Laboratorio 301)
1.9. Prof. RESPONSABLE
Prof. Invitados
Asistentes de laboratorio
: Mg. Jorge León Quispe
: Dra. Haydee Montoya T
Dr. Pablo Ramírez R
Mag. Mario Alcarraz Cuir
Mag. Carmen Ruíz Huamán
Blga. Mónica Huamán Iturrizaga
Blga. Lidia R. Sánchez Pérez
Blga. Maribel Baylón Coritoma
Bach. Stephanie Montero Trujillo
Bach. Nadia Galindo Cabello
Bach. Mirko Lino Navarro
: Est. Claudia Mateo Tuesta
Est. Jéssica Cisneros Moscol
Est. Ulrike Tarazona Janampa
Est. Junior Caro Castro
Est. Abigail Gutierrez Espinosa
Est. Carolina Quispe Soto
II. SUMILLA:
El curso trata sobre el significado de los microorganismos en los ecosistemas naturales.
Analiza sus principios en relación a la evolución, biodiversidad, interrelación con su entorno
biótico-abiótico, distribución, composición y rol ecofisiológico de las comunidades
microbianas en los diversos ecosistemas y ciclos biogeoquímicos. Se pone énfasis en las
técnicas de aislamiento y evaluación de microorganismos en ambientes naturales.
III. OBJETIVOS:
3.1 OBJETIVO GENERAL:
Adquirir una visión global de comunidades microbianas procariotas y eucariotas
presentes en diversos ecosistemas, y comprender sus orígenes, funciones, interacciones
y principios para su aislamiento y uso práctico.
3.2 OBJETIVOS ESPECÍFICOS:
 Analizar la diversidad microbiana y comprender sus actividades en los
ecosistemas en que proliferan.
 Analizar los factores que regulan el crecimiento microbiano en la naturaleza, sus
interrelaciones con otros organismos y el rol en los ciclos de la materia.
 Comprender principios básicos de la ecología microbiana y su potencial
aplicación en procesos biotecnológicos relacionados a la conservación del medio
ambiente.
IV. EVALUACIÓN: (Permanente)
Exámenes de teoría
:
02
Exámenes de práctica :
02
Adicionalmente se calificará la exposición de seminarios, discusión de
artículos científicos, presentación de informes y participación del
alumno en clases teórico-práctica.
Nota promedio:
Coeficiente.
Exámenes de teoría
3,5
Exámenes de práctica
3,5
Exposición de seminarios
1,0
Presentación de informes
1,0
Participación en clases y asistencia
1,0
V. METODOLOGÍA.
 El desarrollo del curso comprenderá clases de teoría, práctica y discusión de seminarios.
 Las clases de teoría serán de tipo expositiva con ayuda de equipo audiovisual
promoviéndose en todo momento la participación de estudiantes.
 Las clases de práctica se realizarán en el laboratorio mediante clases experimentales cortas,
promoviéndose trabajos grupales.
 Se discutirán seminarios previa exposición y análisis de literatura científica actualizada.
VI. PROGRAMACIÓN.
CONTENIDO:
PROFESOR
1° SEMANA (18 - 22 agosto).
 T1: Generalidades. Desarrollo histórico de Ecología Microbiana. Fuentes de información.
Microorganismos en el medio ambiente.
J. León
 T2: Diversidad metabólica microbiana. Organismos fototróficos, litotróficos. Organismos
organotróficos. Organismos autotróficos y heterotróficos.
J. León
2° SEMANA (25 - 29 agosto).
 T3: Interacciones entre poblaciones microbianas. Interacciones positivas y negativas.
Modelos microbianos de interacciones poblacionales.
J. León
 P1: Salida de campo: Toma de muestras.
J. León
 P2: Técnicas de enumeración de bacterias ambientales. Recuento total de heterótrofos
3° SEMANA (01 – 05 setiembre).
 T4: Interacciones de microorganismos- plantas. Microorganismos de la rizósfera y filósfera.
Micorrizas. Bacterias nodulares y simbiosis.
J. León
 P3: lectura de la P2. Interpretación.
J. León
 P4: Estratificación de microorganismos fotótrofos en Columnas de Winogradsky.
J. León
4° SEMANA (08-12 setiembre).
 T5: Interacciones de microorganismos-animales. Comensalismo, mutualismo y sinergismo
de microorganismos-animales. Predación animales-hongos. El ecosistema microbiano del
rúmen.
J. León


P5: 1° lectura e interpretación de la “Columna de Winogradsky” (P4)
P6: Antagonismo bacteriano.
M. Alcarraz
5° SEMANA (15 - 19 setiembre).
 Exposición de seminarios (1° parte)
 P7: lectura de la P6 (Antagonismo bacteriano)
 P8: 2° lectura e interpretación de la “Columna de Winogradsky” (P4)
M. Alcarraz
J. León
6° SEMANA (22 - 26 setiembre).
 T7: Desarrollo de las comunidades microbianas. Dinámica poblacional. Estrategias r y k.
Sucesión microbiana. Estructura de las comunidades microbianas.
J. León
 P9: Recuento directo de bacterias ambientales por epifluorescencia
N. Galindo
 P10: 3° lectura e interpretación de la “Columna de Winogradsky” (P4)
J. León
7° SEMANA (29 set - 03 octubre).
 T9: Métodos moleculares en el estudio de comunidades microbianas.
 P11: Evaluación microbiana de suelos: “técnica de laminilla”
 P12: Lectura de la P11 (“técnica de laminilla”)
P. Ramírez
M. Huamán
M. Huamán
8° SEMANA. Miércoles 09 de octubre: Primer examen (teoría – práctica). J. León
9° SEMANA (13 - 17 octubre).
 T10: Ecología fisiológica de microorganismos: adaptación a las condiciones ambientales.
Limitaciones abióticas y determinantes ambientales.
M. Lino
 P13: Sucesión microbiana en ambientes acuáticos (formación de biofilms) M. Huamán
 P14: lectura de la P13 (formación de biofilms).
M. Huamán
10º SEMANA (20 - 24 octubre)
 T11: Los hábitat naturales. Microorganismos en la atmo-ecósfera.
J. León
 T12: Microalgas y cianobacterias, su importancia ecológica y económica. H. Montoya
 P15: Exposición de seminarios: 2° parte
 P16: Diversidad de microalgas y cianobacterias en muestras de aguas continentales.
M. Baylón
11° SEMANA (27 – 31 octubre).
 T12: Hidro-ecósfera. Estructura y dinámica de poblaciones microbianas en ambientes
marinos y aguas continentales.
J. León
 T13: Microorganismos bentónicos en la mineralización de la materia orgánica en
ecosistemas marinos.
N. Galindo
 P17: Observación de protozoarios de vida libre en ambientes acuáticos.
L. Sánchez
 P18: Continuación de la P17
L. Sánchez
12° SEMANA (03 – 07 noviembre).
 T14: Conferencia: Las floraciones microalgales y sus implicancias en la producción de
biotoxinas marinas.
C. Ruíz H
 T15: Lito-ecósfera. El suelo como hábitat microbiano. Patrones de distribución microbiana.
Mineralización y descomposición de residuos.
M. Alcarraz
 P19: Aislamiento de bacterias termófilas, psicrófilas y halófilas
M. Huamán
13° SEMANA (10 – 14 noviembre).
 T16: Rol de los virus marinos y sus implicancias en el ecosistema global. S. Montero
 P20: Lectura de la P19
M. Huamán
 P21: Aislamiento y evaluación de rizobacterias
J. León
14° SEMANA (17 - 21 noviembre).
 T17: Ciclo del carbono. Transferencia de carbono a través de las cadenas tróficas.
Metanogénesis y metilotrofía. Acetogénesis. Degradación de polisacáridos. J. León
 T18: Ciclo del nitrógeno en la naturaleza. Desnitrificación. Nitrificación. Fijación de
nitrógeno. Rol ecológico de bacterias en el ciclo del nitrógeno.
J. León
 P23: Lectura de la P21
J. León
15° SEMANA (24 - 28 noviembre).
 T19: Ciclo del azufre, con énfasis en ecosistemas marinos. Actividad microbiana sobre el
H2S y su significado ecológico.
J. León
 T20: Ciclo de hierro. El papel de los microorganismos en la oxidación del hierro en la
naturaleza. Lixiviación microbiana.
J. León
 P23: Exposición de seminarios (3ª parte).
16° SEMANA. Miércoles 03 diciembre: 2° Examen teórico - práctico
J. León
17º SEMANA. Miércoles 10 diciembre: Examen Sustitutorio.
VII. REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS.
TEXTOS:
1. ALET, K., and P. NANNIPIERI (eds.). 1995. Methods in Applied Soil Microbiology and
Biochemistry Academic Press, London.
2. ATLAS, R and R. BARTHA. 2002. Ecología Microbiana y Microbiología Ambiental.
Addison Wesley Publishing Company. USA.
3. BURLAGE R., ATLAS R., STAHL D., GEESEY G. & SAYLER G. 1998. Techniques in
Microbial Ecology. Oxford University Press.
4. FENCHEL T. KING G.M & BLACKBURN T.H. 2000. Bacterial Biogeochemistry: The
Ecophysiology of Mineral Cycling. Great Britam.
5. Microbiología de PRESCOTT, HARLEY Y KLEIN. 2009. 7° Edición.
6. KIRCHMAN D.L. 2000. Microbial Ecology of the Oceans. USA.
7. MADIGAN M., MARTINKO J. & PARKER J. 2009. Brock, Biología de los
Microorganismos. 12 Edición. Pearson – Addison – Wesley.
8. PICKUP R.W; SAUNDERS J.R. 1998. Molecular approaches to environmental
microbiology. Cambridge. Great Britam.
REVISTAS ESPECIALIZADAS (JOURNAL):
1. Advances in Microbial Ecology.
2. Applied and Environmental Microbiology
3. Aquatic Microbial Ecology
4. Environmental Microbiology
5. Extremophiles.
6. FEMS Microbiology Ecology.
7. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology
8. Microbial Ecology and biogeochemistry
9. Microbial Ecology.
10. Microbiological Reviews.
11. Soil Biology and biochemistry.
12. The ISME Journal: Multidisciplinary journal of microbial ecology