28. En una investigación de la enzima fumarasa del corazón de cerdo, los parámetros cinéticos de la reacción directa son Km = 1,7 mM, V máx = 2,5 mM/min y para la reacción inversa Km = 3.8 mM, V máx = 1.1 mM/min. Estime la constante de equilibrio para la reacción entre el fumarato y el malato. En un experimento en una muestra de fumarasa de otra fuente, los parámetros cinéticos informados son: Km = 1.6 mM, V máx = 0.24 mM/min para la reacción directa Km = 1.2 mM, V máx = 0.12 mM/min para la reacción inversa. R. Comente la factibilidad de este reporte. Las constantes de equilibrio calculadas son diferentes, lo que indicaría error experimental o bien condiciones experimentales diferentes (p.e. temperatura; el pH no debería afectar (¿?)). 29. La reacción CO2 + H2O H+ + HCO3catalizada por la enzima anhidrasa carbónica, se ha estudiado a pH = 7,1 y a una temperatura de 0,5ºC. Para una concentración inicial de enzima de 2,8 x 10 -9 mol/lt, las velocidades iniciales en función de la concentración de CO2 son: [CO2] (mmol/lt) 1,25 2,50 5,00 20,00 a. b. c. d. a. b. c. 30. R: v (mmol/lt x seg) 0,028 0,048 0,080 0,155 Determine K m y V máx por el método Hanes-Woolf. Determine k cat. A [S] << Km determine k obs. de la reacción. Determine el número de recambio de la anhidrasa carbónica. a 40,05 Km = 8,99 mM b 4,4537 Vmax = 0,2245 mM/s R 0,9998 kcat = 80190,32 s-1 kobs = 0,0250 s-1 kcat/Km = 8916,6 mM s-1 ¿Cuál es la actividad relativa y el porcentaje de inhibición causado por un inhibidor competitivo si [S] = Km y [I] = Ki? ar = 0,66 % i = 34 % 11 31. Un microorganismo contiene una enzima que hidroliza la glucosa 6 sulfato (S). El ensayo se basa en la velocidad de aparición de la glucosa. La enzima presenta un Km = 6,7x10-4M y Vmáx = 300 nmoles/lt x min. La galactosa 6 sulfato es un inhibidor competitivo. A una concentración de galactosa 6 sulfato de 10-5M y glucosa 6 sulfato de 2 x 10-5M, la velocidad es 1,5 nmoles/lt x min. Calcular Ki para galactosa 6 sulfato. R: Ki = 2,02 x 10-6 M. 32. Calcular Ki para un inhibidor no competitivo si la [I] = 2x10-4M da un 75 % de inhibición para una reacción catalizada enzimáticamente. R: Ki = 6,67 x 10-5 M. 33. Una enzima presenta un Km de 4,7x10-5 M. Si la Vmax de la preparación es 22 (moles/l x min), qué velocidad se observaría en la presencia de 2x10-4 M de sustrato y 5x10-4 M de un inhibidor : a) competitivo, b) no competitivo y c) acompetitivo. El Ki en todos los casos es 3x10-4 M. d) ¿Cuál es, en cada caso, el grado de inhibición? 34. Cierta enzima es inhibida de modo competitivo, pero en diferentes grados, por tres inhibidores a igual concentración, I1, I2 e I3. Las constantes de disociación de los inhibidores son Ki1 = 0,1 mM, Ki2 = 0,01 mM y Ki3 = 1,0 mM. ¿Cuál inhibidor ocasionaría la inhibición más acentuada? ¿Y cuál la más leve ? Fundamente su respuesta. R: A menor Ki mayor inhibición. ¿FUNDAMENTO? 35. A partir de los siguientes datos de velocidad, determinar la naturaleza de cada inhibidor y el Ki: _____ [S] mM 0,200 0,250 0,333 0,50 1,00 2,00 2,50 3,33 4,00 5.00 R: I 16,67 20,00 24,98 33,33 50,00 66,67 71,40 76,92 80,00 83,33 +I 6 M vo 6,25 7,69 10,00 14,29 25,00 40,00 45,45 52,63 57,14 62,50 inhibidor competitivo, Ki = x 30 M nmoles/min 5,56 6,67 8,33 11,11 16,67 22,22 23,81 25,64 26,67 27,77 Y 4 mM Z 0.2 mM 10,00 11,11 12,50 14,29 16,67 18,18 18,52 18,87 19,00 19,23 8,89 10,81 13,78 19,05 30,77 44,44 48,78 54,06 57,14 60,60 2,98 M 12 X inhibidor no competitivo, Ki = Y inhibidor acompetitivo, Ki = Z inhibidor lineal mixto, Ki = Vmax = 100 nmoles/min, Km = 1 mM. 1,5 M 1,0 mM 0,2 mM Ki' = 0,8 mM 36. Si el Km de una enzima para su sustrato es 10-5 M y el Ki de la enzima para un inhibidor competitivo es 10-6 M, cuál es la concentración del inhibidor que se requiere para que disminuya la velocidad de la reacción en un factor de 10, cuando la concentración de sustrato es 10-5 M?, 0.01 M? R: [S] = 1,8 x 10-5 M, [S] = 9,0 x 10-3 M. 37. Se estudió el efecto de uno de los productos (piruvato) en la reacción catalizada por la lactato deshidrogenasa de músculo de conejo con los siguientes resultados : NAD+ + lactato NADH + piruvato A una concentración constante de NAD+ (1,5 mM) [lactato] mM [piruvato] M 1,5 2,0 3,0 velocidad ( moles / min) 0 1,88 2,36 3,10 40 1,05 1,34 1,88 80 0,73 0,94 1,34 . 10,0 . 5,81 4,19 3,27 A una concentración constante de lactato (15 mM) [piruvato] M 0,5 0 30 60 3,33 2,65 1,97 [NAD+] mM 0,7 1,0 2,0 velocidad ( moles / min) 3,91 4,50 5,42 3,13 3,60 4,33 2,30 2,66 3,21 ¿Qué tipos de inhibición se observan en estos casos? ¿Cuál sería el mecanismo cinético de esta reacción Bi-Bi? Calcule los parámetros cinéticos y termodinámicos correspondientes. R: A [NAD+] constante Km = 5,94 mM, Vmax = 9,20 moles/min, Ki (pir) = 46,38 M, 13 A [lactato] constante Km = 0,53 mM, Vmax = moles/min, [pir] = 0 5,8460 0,1087 0,9999 Ki (pir) = 85,16 M. [pir] = 40M 1,2622 11,23 0,1124 8,90 0,9999 5,85 9,20 [pir] = 80M 1,8862 16,09 0,1172 8,53 0,9999 [I] ap K m = Km (1+ ) Ki Km ap [I] K m = Km + Ki 5,9367 0,128 0,9996 [pir] = 0 0,077 0,1460 0,9999 Km = 5,9 Ki = 46,38 0,53 6,85 [pir] = 30 M 0,0963 0,53 0,1826 5,48 0,9999 Vm ax [I] (1 + ) Ki ap Vm ax = 1 ap Vm ax 0,1415 1,662exp-3 0,9882 = [pir] = 60 M 0,1311 0,53 0,2459 4,07 0.9999 1 Vm ax + [I] Vm axKi Vmax = 7,06 Ki = 85,16 14 38. La carbobenzoxi-L-glutamil-L-tirosina es hidrolizada por la pepsinasa (catepsina) del riñón de cerdo, de acuerdo con la siguiente reacción : ácido carbobenzoxi-L-glutámico + L- Carbobenzoxi-L-glutamil-L-tirosina + H2O tirosina El curso de la reacción puede seguirse manométricamente mediante la adición de tirosina descarboxilasa que produce liberación de CO2 y la formación de tiramina. L-tirosina tiramina + CO2 Se ha descubierto que el ácido carbobenzoxi-L-glutámico formado en la hidrólisis tiene efecto inhibidor en la reacción. A partir de las cifras dadas demostrar este efecto, determinando el tipo de inhibición, Ki y los parámetros cinéticos de la reacción. [S] moles/ml 4,7 4,7 4,7 6,5 6,5 6,5 10,8 10,8 10,8 30,3 30,3 30,3 [P] moles/ml 0,0 7,58 30.3 0,0 7,58 30,3 0,0 7,58 30,3 0,0 7,58 30,3 v molesCO2/ml x min 0,0434 0,0285 0,0144 0,0526 0,0357 0,0192 0,0713 0,0512 0,0295 0,1111 0,0909 0,0619 39. Se estudió la velocidad de la reacción catalizada por la piruvato quinasa en función de la concentración del fosfoenol- piruvato (PEP) con los resultados indicados en la fila A. 2 PEP ADP Mg Piruvato ATP (Se supone que el ADP está saturante). También se dan los datos de los efectos de dos inhibidores de está reacción. En la fila B los datos se refieren al 2-fosfoglicerato 10 mM como inhibidor y en la fila C se refieren a la fenilalanina 10 mM como inhibidor. 15 Comentar estos datos. R: Inhibidor A/ nada B/ 2-fosfoglicerato C/ fenilalanina [PEP] (mM) 0,25 0,30 0,50 1,00 2,00 velocidad ( mM/min ) 1,10 1,25 1,63 2,05 2,43 0,73 0,83 1,15 1,68 2,08 0,60 0,68 0,90 1,25 KiB = 12,86 mM, alfa = 2, KiC = 9,44 mM, Ki'C = 19,2 mM Vmax = 2,92 mM/min, Km = 0,41 mM. 1,50 40. Se encuentra que los protones actúan en un sistema enzimático como inhibidores no competitivos. Para una reacción tipo Uni-Uni : a. Escriba el mecanismo general correspondiente. b. Haga la deducción de la ecuación de velocidad, suponiendo estado estacionario para el cambio químico y equilibrio rápido para las reacciones ácido-base. c. Indique cómo puede obtener los parámetros cinéticos V max y Km (independientes del pH) y la constante de disociación de la enzima libre y del complejo E-S. v = Km V max [H+ ] (1 + ) KES [H+ ] (1 + ) KE [H+ ] (1 + ) KES [S] + [S] 41. Se encuentra que un ión metálico A es un activador esencial de una enzima y que su unión es previa a la del sustrato (S). Escriba el mecanismo general correspondiente, deduzca la ecuación de velocidad suponiendo equilibrio en los pasos anteriores al cambio químico. Indique el significado operacional y físico de los parámetros V max ap y Km ap (cuando [A] = constante) y de V max y Km. v = V max [S] KEA ) + [S] KESA (1 + [A] 42. La hidrólisis de la lactosa por la enzima ß-galactosidasa sigue aparentemente un mecanismo tipo ping-pong. Indique cómo determinar el KmA (A = lactosa) y la velocidad máxima (V max) en un sistema 16 acuoso. lactosa + H2 0 v = glucosa + galactosa Vm ax [A][B] B Km [B] + Km [A] + [A][B] A 43. Ud. desea determinar si una reacción enzimática, en la que participan dos sustratos (A y B) y dos productos (P y Q), sigue un mecanismo tipo secuencial ordenado o tipo ping-pong. A + B P + Q Indique la forma de discriminar entre estos mecanismos. Fundamente su respuesta en base a las ecuaciones y ráficos correspondientes. Ecuaciones de velocidad : Mecanismo secuencial ordenado : v = Vm ax[A][B] A B K A Km + Km [B] + Km [A] + [A][B] B Mecanismo ping-pong : v = Vm ax[A][B] B Km [B] + Km [A] + [A][B] A ¿Puede Ud. distinguir en la misma forma entre un mecanismo secuencial ordenado y uno secuencial desordenado? Fundamente su respuesta. 17 44. Se hizo un estudio de la reacción catalizada por creatinaquinasa de músculo de conejo : creatina + MgATP2 fosfo- creatina + MgADP- Se obtuvieron los siguientes datos : [creatina](mmol/lt) 6 10 20 40 0,46 0,62 0,377 0,555 0,845 1,180 0,463 0,678 1,005 1,378 [ATP] (mmol/lt) 1,23 velocidad (catal/Kg) 0,660 0.950 1,338 1,718 3,68 0,968 1,308 1,803 2,295 Calcular los parámetros cinéticos para esta reacción. De otros datos parece ser que la reacción tiene lugar vía un mecanismo de complejo ternario formado de una manera desordenada. ¿Qué puede deducirse de la unión de los sustratos a la enzima? v = Vm ax[A][B] K A KB + K A [B] + KB [A] + [A][B] [ATP] = 0.46 mM Kmap/Vmaxap 12.8129 pendiente 0.5296 0.9999 Km = 24.1941 mM Vmax = 1.8883 catal/Kg [ATP] = 0.62 mM Kmap/Vmaxap 10.1459 pendiente 0.7444 0.9997 Km = 21.3878 mM Vmax = 2.1080 catal/Kg Km = 15.3942 mM Vmax = 2.3783 catal/Kg Km = 13.1852 mM Vmax = 3.00388 catal/Kg [ATP] = 1.2 mM Kmap/Vmaxap 6.4729 pendiente 0.4205 0.9999 [ATP] = 3.68 mM Kmap/Vmaxap 4.3389 pendiente 0.3291 0.9997 18 v = Vmax [B] [A] KB + [B] K A KB + K A [B] + [A] KB + [B] Vmapax = 1 = V max R: Vm ax[B] KB + [B] KB V max [B] Vmax = 3,36 cat/Kg KA ' = 10,60 mM KA = 35,83 mM KB ' = 0,40 mM KB = 1,36 mM 1 + V max alfa = 0,30 45. Se obtuvieron los siguientes datos estudiando la reacción catalizada por la deshidrogenasa alcohólica de la levadura de cerveza : etanol + NAD+ acetaldehído + NADH + H [etanol] (mmol/l) 10 20 40 200 0,05 0,30 0,44 0,57 0,76 [NAD+] (mmol/l) 0,1 velocidad (catal/Kg) 0,51 0,89 0,75 1,32 0,99 1,72 1,31 2,29 0,25 1,0 1,43 2,11 2,76 3,67 Determinar los parámetros cinéticos para esta reacción. Proponer el mecanismo involucrado. R: Km (etanol) = 17,9 mM Km (NAD+) = 0,25 mM Vmax = 5,01 catal/min. 46.- La enzima nucleósido difosfoquinasa cataliza la siguiente reacción : 19 2 GTP dGDP Mg GDP dGTP En un experimento con el enzima aislado de eritrocitos se obtuvieron los siguientes resultados : 22 [dGDP] (mol/l) 20 0,095 25 0,102 40 0,112 100 0,125 [GTP] (mol/l) 30 50 velocidad (catal/Kg) 0,112 0,141 0,120 0,155 0,136 0,180 0,156 0,218 200 0,196 0,223 0,284 0,385 ¿Qué puede decirse de estos datos en cuanto al mecanismo probable para la reacción enzimática? Calcule los parámetros cinéticos (KmA, Km B, V max). 20 36. A partir de los siguientes datos de velocidad, determinar la naturaleza de cada inhibidor y el Ki: _____ [S] mM 0,200 0,250 0,333 0,50 1,00 2,00 2,50 3,33 4,00 5.00 R: 16,67 20,00 24,98 33,33 50,00 66,67 71,40 76,92 80,00 83,33 +I 6 M vo 6,25 7,69 10,00 14,29 25,00 40,00 45,45 52,63 57,14 62,50 I inhibidor competitivo, Ki X inhibidor no competitivo, Ki Y inhibidor acompetitivo, Ki Z inhibidor lineal mixto, Ki Vmax = 100 nmoles/min, Km = 1 mM. [I] = 0 0,010 0,010 0.9999 1,00 mM 100,00 [x] = 30 M 0,030 1,00 mM 0,030 33,33 0,9999 x 30 M nmoles/min 5,56 6,67 8,33 11,11 16,67 22,22 23,81 25,64 26,67 27,77 = = = = [I] = 6M 0,030 0,010 0,9999 [Y] = 4mM 9,97x100,030 0,9999 2,98 M 1,5 M 1,0 mM 0,2 mM Y 4 mM Z 0.2 mM 10,00 11,11 12,50 14,29 16,67 18,18 18,52 18,87 19,00 19,23 8,89 10,81 13,78 19,05 30,77 44,44 48,78 54,06 57,14 60,60 Ki' = 0,8 mM 3,00 mM 100,00 0,20 mM 19,82 [Z] = 0,2 mM 0,020 2,00 mM 0,0125 80,00 0,9999 21