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DETECCION DE ESPECIES DE STREPTOMYCES
EN TUBERCULOS DE PAPA Y SUELOS CULTIVADOS
EN ARGENTINA MEDIANTE PCR
Streptomyces scabies
Sarna común de la papa
Los órganos más afectados son los tubérculos.
Síntomas característicos
 Pústulas o lesiones levantadas de forma circular y aspecto corchoso.
 Lesiones hundidas.
 Lesiones necróticas poliédricas o estrelladas.
Agente causal
Streptomyces scabies, con cadenas de esporas dispuestas en forma
helicoidal, produce melaninas, pH óptimo entre 5.2 y 7. En Argentina
fue reportada en Buenos Aires, Mendoza y Córdoba (Escande y
Melegari) y en Chaco por Bonasic Kresic. (Atlas Fitopatológico de
Argentina).
S. acidiscabies, con cadenas de esporas flexuosas y puede
sobrevivir en suelos ácidos (hasta pH 4.5).
S. turgidiscabies, con cadenas de esporas flexuosas, sin producción
de melaninas. Fue descripta por primera vez en Japón, actualmente
se reportó su presencia al N de Europa.
 Los genes responsables de la patogenicidad fueron transferidos
desde S. scabies hacia las otras dos especies.
Zonas productoras de papa en Argentina (Caldiz & Struik, 1999)
Período de crecimiento:
• temprano. invierno
• semitemprano. primavera
• semitardío. verano
• tardío. otoño
Localidad
Producción
Tucumán
temprana
Córdoba
semitemprana
Mendoza
semitemprana
semitardía
Santa Fe y Bs As NW
semitemprana
tardía
Bs As SE
semitardía
Río Negro y Chubut
semitardía
Mecanismos de control
 Semillas de tubérculos sanos
 Rotar el cultivo con maíz, trigo, cebada, alfalfa, evitar la rotación con
plantas hospedantes como remolacha, zanahoria y trébol rojo.
 Mantener pH del suelo entre 5 y 5.2
 Evitar o limitar las aplicaciones de estiércol.
 Mantener la humedad del suelo en capacidad de campo.
 Resistencia
 Fungicidas (mancozeb, pentacloronitrobenceno, urea formaldehída
líquida).
 Control biológico uilizando cepas no patogénicas de Streptomyces spp. y
Trichoderma spp.
Conocer las especies productoras de sarna común
en papa en Argentina
Método
1) Extracción y purificación de ADN de suelo y lesiones de tubérculos.
2) PCR diagnóstica usando primers especie-específicos para:
Streptomyces scabies
S. acidiscabies
S. turgidiscabies
3) Comparación de las secuencias obtenidas con las secuencias
presentes en bases de datos.
Table 1. Soil sampling sites and main crops
Location
Province
Main crop
Balcarce
Vedia
Choele Choel
Marcos Juárez
Leones
Villa Alberdi
Buenos Aires
Buenos Aires
Río Negro
Córdoba
Córdoba
Tucumán
Potato
Soybean
Potato
Soybean
Soybean
Tobacco
Table 2. Primer sequences and respected sizes of PCR products in the present experiment
Species
Primer
Sequence (5'-3')
Streptomyces acidiscabies
AC-03
AC-04
TACCGGATATCACTCCTGCCT
GGCGACCATCTCTGGCCGTT
836
S. scabies
SC-05
SC-06
CCGGTAGCCCAACCCGTAAG
GTAGTACTCACAGCCTCCGG
236
S. turgidiscabies
TU-01
TU-02
GGAAACATCCAGAGATGGGTG
GACAGTACTGGAAGGAGAAGA
686
M
bp
1000
500
S. acidiscabies
1 2 3 4 5 6
1
S. scabies
2 3 4 5
Size (bp)
6
S. turgidiscabies
1 2 3 4 5 6
Table 5. Homology of the sequences of PCR bands with the reference sequence
Accession number of the
referece sequence
Homology (%)
Streptomyces acidiscabies
AB026220
99.4
S. scabies
AB026199
98.7
S. turgidiscabies
AB026221
97.2
Species
Detección en lesiones
Table 3. Detection of Streptomyces species in lesions using PCR
Location Cultiver
Market
Unknown
Balcarce Shepody
Innovator
1
No. of lesions infested with1
Tuber
No. of tested
lesions
AC+SC+TU
AC+SC
SC+TU
SC
A
B
C
2
2
2
2
1
1
0
1
0
0
0
0
0
0
1
A
B
C
D
E
F
A
5
5
4
4
1
1
5
5
5
4
4
1
1
3
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
2
0
0
0
0
0
0
0
AC,S. acidiscabies ; SC, S. scabies ; TU, S. turgidiscabies
Detección en suelos
Table 4. Detection of Streptomyce s species in soil using PCR
Location
Soil pH
Replicate
AC1
SC2
TU3
Balcarce4
6.6
6.3
6.5
6.1
6.1
6.1
1
2
3
1
2
3
+
+
+
-
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
6.7
6.6
6.7
6.5
6.4
6.5
6.3
6.1
6.2
6.1
6.1
1
2
3
1
2
3
1
2
3
1
2
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
Tucumán
Choele Choel4
Vedia
Leones
Marcos Juarez
1
S. acidiscabies
S. scabies
3
S. turgidiscabies
2
4
Potato production areas.
Presencia de las
distintas
especies en los
suelos muestreados
Conclusiones
 Se cita por primera vez para Argentina la presencia de
S. acidiscabies y S. turgidiscabies.
 Detección de la presencia de los patógenos en áreas de producción
papera y no papera.
 Se comprobó que este método de detección es preciso y rápido
Para diagnosticar la presencia de especies de Streptomyces en suelo.
Muchas gracias