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De dónde viene el término Fenómica?
Determinar los factores
que los determinan no es
tarea fácil
Definiciones de fenómica
Phenomics is the study of phenomes — the physical and biochemical
traits of organisms — as they change in response to genetic mutation
and environmental influences
“Phenomics is an emerging transdiscipline
dedicated to the systematic study of
phenotypes on a genome wide scale”
“The acquisition of high-dimensional phenotypic data on an organism-wide scale”
Para qué?
Los fenotipos son las características de los organismos
que más interesa a los biólogos
Resistencia a patógenos
Rendimiento
Fertilidad - Reproducción
¿Por qué varía el fenotipo entre poblaciones o entre especies?
Para qué?
Identificar las bases genéticas de caracteres complejos
Riesgo de Diabetes tipo II
GWA
AUC=0.78
asociaciones
AUC=0.54
Porcentaje de la varianza
fenotípica expilcada?
Información fenotípica adicional: más informativa que aumentar la lista de asociaciones
Para qué?
Estudio de los mapas genotipo-fenotipo
Houle et al. Nature, 2010
Caracterizando fenomas
Houle et al. Nature, 2010
Caracterizando fenomas
Caracterizando fenomas
Caracterizando fenomas
Caracterizando fenomas
Golzarian et al. 2011
Caracterizando fenomas
Caracterizando fenomas
Razones para una aproximación fenómica
Aproximaciones
conceptuales, analíticas
y bioinformáticas para
Tecnologías de
fenotipificación de alto
rendimiento
“highthroughput
phenotyping”
Decile SÍ
a
bases de
datos multidimensionales
la
Datos
fenotípicos
Modelos
fenómica!
dinámicos
siguen siendo
para conectar
fenómenos a distintos
los mejores predictores
niveles de organización
de “outcomes”
biológicos.
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