Planeación y manejo de la informática médica Introducción El curso tiene como objetivo el facilitar la comprensión, a un nivel general, del método epidemiológico a modo de sustento para estudios o artículos con carácter científico. Con este propósito se pretende: 1. Dar a conocer el paquete estadístico para computo SPSS1 con el propósito de aprender a interactuar con él. 2. Contribuir con una cultura general relacionada con la estadística descriptiva y los diseños epidemiológicos, para construir un panorama aproximado de las herramientas metodológicas usadas en el proceso de generación de información a partir de propuestas o estudios con carácter científico. I- Sensibilización al paquete estadístico SPSS. Pantallas básicas y sus extensiones. Las pantallas básicas son la de datos y la de productos de trabajo o “output” o visor, con las extensiones: .sav y .spo, respectivamente. Existen más tipos de pantallas pero nos enfocaremos a estas dos. La de datos (.sav) se puede entender como una hoja de calculo, las columnas corresponden a las variables y las filas a los individuos u observaciones realizadas. La de productos (.spo) es útil para llevar el registro de las respuestas de cálculos y gráficos que da la máquina y puede ser ocupada como pagina de texto. 1. Menú y submenú Existen diferentes ofertas de menú en SPSS las cuales describiremos: Editor de datos: este menú muestra los contenidos del archivo de datos. Como el editor de datos puede crear nuevos archivos de datos o modificar los existentes. La ventana del Editor de datos se abre automáticamente cuando se inicia una sesión de SPSS. No se puede tener más de un archivo de datos abierto al mismo tiempo. (extensión .sav ) Visor: Todas las tablas, los gráficos, y los resultados estadísticos se muestran en el visor. Puede editar los resultados y guardarlos para utilizarlos posteriormente. La ventana del visor se abre automáticamente la primera vez que se ejecuta un procedimiento para generar datos. (extensión .spo) 1 Statistical Package for Social Sciences. Visor de borrador: Los resultados pueden mostrarse como texto normal Editor de tablas pivote: Es posible modificar los resultados mostrados en este tipo de tablas de diversas maneras. Puede editar el texto, intercambiar los datos de las filas y las columnas, añadir colores, crear tablas multidimensionales y ocultar o mostrar los resultados de manera selectiva. Editor de gráficos: Puede modificar los gráficos y diagramas de alta resolución en las ventanas de los gráficos. Es posible cambiar los colores, seleccionar diferentes tipos de fuente y tamaños, intercambiar los ejes horizontal y vertical, rotar diagramas de dispersión 3 -D e incluso cambiar el tipo de gráfico. Editor de resultados de texto: Los resultados de texto que no aparecen en las tablas pivote pueden modificarse con el editor de resultados de texto. Puede editar los resultados y cambiar las características de las fuentes (tipo, estilo, color y tamaño). Editor de sintaxis: Puede pegar las selecciones del cuadro de dialogó en una ventana de sintaxis, donde aparecerán en forma de sintaxis de comandos. También puede guardar los comandos en archivo para utilizarlos en sesiones posteriores. Editor de procesos: El procesamiento y la autorización OLE permiten personalizar y automatizar muchas tareas en SPSS. Utilice el Editor de procesos para crear y modificar los procesos en Basic. 2. Abrir, cerrar, copiar, pegar y guardar un archivo Es posible cortar y pegar valores de casilla individuales o grupos de valores en el Editor de datos. Puede hacer todo esto: Mover o copiar un único valor de casilla a otra casilla Mover o copiar un único valor de casilla a un grupo de casillas Mover o copiar los valores para un único caso (fila) en casos múltiples Mover o copiar los valores de una única variables (columna) en variables múltiples Mover o copiar un grupo de valores de casilla en otro grupo de casillas Almacenamiento de datos: Tipos de archivos de datos Puede guardar en los siguientes formatos: SPSS (*.sav ). Formato SPSS: Los archivos de datos guardados con formato SPSS para Windows, pero no incluyen los conjuntos de respuestas múltiples definidos ni información sobre la introducción de datos para Windows. SPSS/PC+ (*.sys ). Formato SPSS/PC+. Si el archivo de datos contiene más de 500 variables, sólo se guardaran las primeras. Para las variables con más de un valor perdido definido por el usuario, los valores perdidos definidos por el usuario adicionales se recodificarán en el primero de estos valores. SPSS portátil (*.por). El formato portátil de SPSS puede leerse en versiones de SPSS para otros sistemas operativos (por ejemplo, Macitosh y UNIX) Cambios en un archivo de datos Cualquier cambio que realice en un archivo de datos se mantendrá solamente durante la sesión actual, a menos que guarde los cambios de manera explícita. Para guardar los cambios de un archivo de datos Active la ventana del editor de datos (pulse en cualquier parte de la ventana para activarla). Elija en los menús archivo guardar como… Seleccione un tipo de archivo de la lista desplegable. Introduzca un nombre de archivo para el nuevo archivo de datos. para escribir nombres de variables en la primera fila de una hoja de cálculo o de archivos de datos delimitados por tabuladores: Pulse en Escribir nombres de variables en el cuadro de dialogo de opciones para guardar archivos. 3.- Información sobre el archivo Un archivo de datos contiene mucho más que datos sin formato. También contiene información sobre la definición de las variables, incluyendo: Los nombres de las variables. Los formatos de las variables. Las etiquetas descriptivas de variable y de valor. Esta información se almacena en la parte del diccionario sobre el archivo de datos. El Editor de datos proporciona una forma de presentar la información sobre la definición de la variable. También se puede mostrar la información completa del diccionario para el archivo de datos de trabajo o para cualquier otro archivo de datos. Para obtener información sobre un archivo de datos: Para el archivo de datos elija en los menús: utilidades información del archivo… Para otros archivos de datos, elija en los menús: Archivo mostrar información de datos… Seleccione un archivo del cuadro de dialogo Mostrar información de datos. La información sobre el archivo de datos se muestra en el visor. Para remplazar o modificar un valor de datos Para eliminar el valor anterior e introducir un valor nuevo: Pulse en la casilla ( el valor de la casilla se muestra en el editor de casillas) Introduzca el nuevo valor, el cual remplazara el anterior Pulse intro (o desplácese a otra casilla) para registrar el nuevo valor Para modificar un valor de dato Pulse la casilla Pulse el editor de datos como lo haría con cualquier otro texto Pulse intro ( o desplácese a otra casilla) para registrar el nuevo valor II.- Introducción al método estadístico 1. - Conceptos básicos del método estadístico. 1.1 Dato - variable 1.2 Muestra – universo 1.3 Masa informativa 2- Conceptos y práctica en el paquete estadístico. Una recomendación importante es tener siempre un respaldo de la base de datos antes de cualquier manipulación. Como se define, una variable asigna información sobre las definiciones de datos alas variables. Se pueden definir variables nuevas o ya existentes. La información sobre la definición de datos incluye: Nombre de variable Tipo de datos (numérico, de cadena, fecha, etc.) Etiquetas descriptivas de variable y de valor Códigos especiales para valores perdidos Nivel de medida Definir tipo de variable: especifica la escala de datos de cada variable. Por defecto el paquete estadístico SPSS asume que todas las variables nuevas son numéricas. Se puede utilizar Definir tipo de variable para seleccionar el tipo de datos. El contenido del cuadro de diálogo depende del tipo de datos seleccionados. Para algunos tipos de datos, hay cuadros de texto para el ancho y el número de decimales; para otros simplemente pueden seleccionar un formato de una lista despegable de ejemplos. Los tipos de datos disponibles son numéricos, de coma, de punto, notación científica, fecha, dólar, moneda personalizada y cadena. Ejercicio 1 definir tipo de variable “define variable” ir a la base de datos neumonía.sav mantener pulsado control junto con en el nombre de la primera columna vacía V0001 o pulse en cualquier parte de la columna vacía, pulse dos veces y elija en el menú Dato “date” definir variable… “define variable” aparecerá el cuadro de dialogo Definir variable escribir el nombre de la variable talla pulsar una vez en tipo “type” aparecerá un cuadro de dialogo Definir tipo de variable seleccionar numérico “numeric” definir ancho y decimales (ver ejercicio 3) pulsar continuar “contin” Definir etiquetas: esta función proporciona la posibilidad de describir la variable y el valor de está, aunque el nombre de las variables solo pueden ser de 8 caracteres, las etiquetas de la variable pueden ser hasta de 256 caracteres, y estas etiquetas son visibles en los resultados. Se pueden asignar etiquetas descriptivas de valor a cada valor de una variable Esto es particularmente útil si el archivo de datos utiliza códigos numéricos para representar categorías no numéricas (por ejemplo, los códigos 1 y 2 para hombre y mujer ) Las etiquetas de valor pueden tener una longitud máxima de 60 caracteres. Estas etiquetas están disponibles para variables de cadena larga (variables e cadena con más de 8 caracteres). Continuación del ejercicio 1 definir etiquetas “define labels” pulsar una vez en etiquetas “label” aparecerá un cuadro de dialogo definir etiquetas, en el cual podrán describir detalladamente la variable y su valor “value labels” en el espacio de etiqueta de variable escribir “talla en centímetros” pulsar continuar Contin” pulsar valores perdidos “missing values” Valores perdidos: esta función permite definir los valores de los datos perdidos por el usuario. La utilidad de esta función radica en el poder distinguir cuantos datos se han omitido por el encuestador, a estos datos se les da un tratamiento especial ya que aparecerán marcados y se excluirán de la mayoría de los cálculos. Continuación del ejercicio 1 definir valores perdidos “missing values” Aparecerá la pantalla de dialogo Definir valores perdidos, en el cual encontraran las opciones sin valores perdidos “ no missing values”, valores perdidos discretos “range plus one discrete missing value” Seleccionar valores perdidos discretos, lo cual automáticamente los colocara en el espacio del valor Definir formato de columna: esta función controla el ancho de las columnas del Editor de datos y la alineación de los valores de datos. Los formatos de columna afectan sólo a la presentación de valores en el editor de datos. Al cambiar el ancho de columna no se cambia el ancho definido de la variable. Si el ancho real y definido de un valor es más ancho que la columna, aparecerán asteriscos (**) en la ventana del editor de datos. Continuación del ejercicio 1 definir ancho de columna “define column format” Definir ancho de columna con 6 en “column width” Pulsar continuar Pulsar aceptar “ok” La variable está creada Introducción de datos Es posible introducir datos directamente en el Editor de datos. Es posible introducir datos en cualquier orden. Asimismo se pueden introducir datos por caso o por variable. La casilla activa se resalta con un borde grueso. El nombre de la variable y el número de la fila de la casilla activa se muestra en la esquina superior izquierda del editor de datos. Una recomendación importante cree primero todas sus variables antes de introducir los datos A continuación se les proporcionara una lista de datos correspondientes a los primeros 20 casos de la variable talla que ustedes crearon Ejercicio 2 Introducir los 20 datos dentro de la variable talla 1. - 60 2. - 50 3. - 94 4. - 53 5. - 57 6. - 55 7. - 54 8. - 60 9. - 63 10 .- 106 11. - 50 12. - 51 13. - 67 14. - 54 15. - 63 16. - 56 17. - 50 18. - 71 19. - 62 20. -69 Ejercicio 3 ir a la base de datos neumonía.sav buscar la variable peso en kg. pulse dos veces en el nombre de la variable situado en la parte superior de la columna o pulse en cualquier parte de la columna de la variable y elija en los menús: Datos Definir variable… “define variable” En este momento aparecerá una pantalla la cual contiene la descripción de la variable Observen como esta construida la variable Tipo “type” Etiqueta “label” Valores perdidos “missing values” Alineación “column format” Ejercicio 4 En este ejercicio aprenderemos a transformar una variable cuantitativa discreta en una cuantitativa continua buscar la variable peso en gramos acceder a ella como en el ejercicio anterior una vez obtenido el cuadro de diálogo Definir variable “define variable” pulse una vez en Tipo “type” aparecerá el cuadro de diálogo Definir tipo de variable, el cual se encuentra definido como numérico en los espacios de ancho “ width” y decimales “decimal places” 5 y 0 respectivamente cambiar el ancho por 6 ya que este corresponde a todos los caracteres del dato, el cual incluye números enteros, el punto decimal y los números decimales. Cambiar decimales a 3 pulsar una vez en continuar y esto los llevara de vuelta al cuadro de dialogo Definir variable pulsar una vez en Aceptar “ok” la variable ya esta transformada Ejercicio 5 En este ejercicio trabajaremos con variables cuantitativas discretas buscar la variable ncuarto acceder a ella como en los ejercicios anteriores una vez obtenido el cuadro de dialogo definir variable “define variable” pulse una vez en Tipo “type” aparecerá el cuadro de dialogo Definir tipo de variable en el cual podrán observar como esta construida la variable (numérica, ancho 1, decimales 0) pulse una vez en continuar pulse una vez en Aceptar Frecuencias y medidas de resumen 1. – Tablas y gráficas 1. - Criterios de clasificación 2. - Tipos de estudios III.- Diseños epidemiológicos